論文の概要: Localising the Seizure Onset Zone from Single-Pulse Electrical Stimulation Responses with a Transformer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.20324v1
- Date: Fri, 29 Mar 2024 17:51:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-04-01 14:55:26.076627
- Title: Localising the Seizure Onset Zone from Single-Pulse Electrical Stimulation Responses with a Transformer
- Title(参考訳): 変圧器を用いた単パルス電気刺激応答からの静電オンセットゾーンの定位
- Authors: Jamie Norris, Aswin Chari, Gerald Cooray, Martin Tisdall, Karl Friston, Richard Rosch,
- Abstract要約: 本稿では,Single Pulse Electro Stimulation (SPES) 応答を用いたSOZローカライゼーションのための深層学習の応用を推し進める。
チャネル間アテンションを組み込んだTransformerモデルを提案する。
本研究は, これらのモデルを用いて, 既往の患者に対する汎用性や電極配置の評価を行う。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Epilepsy is one of the most common neurological disorders, and many patients require surgical intervention when medication fails to control seizures. For effective surgical outcomes, precise localisation of the epileptogenic focus - often approximated through the Seizure Onset Zone (SOZ) - is critical yet remains a challenge. Active probing through electrical stimulation is already standard clinical practice for identifying epileptogenic areas. This paper advances the application of deep learning for SOZ localisation using Single Pulse Electrical Stimulation (SPES) responses. We achieve this by introducing Transformer models that incorporate cross-channel attention. We evaluate these models on held-out patient test sets to assess their generalisability to unseen patients and electrode placements. Our study makes three key contributions: Firstly, we implement an existing deep learning model to compare two SPES analysis paradigms - namely, divergent and convergent. These paradigms evaluate outward and inward effective connections, respectively. Our findings reveal a notable improvement in moving from a divergent (AUROC: 0.574) to a convergent approach (AUROC: 0.666), marking the first application of the latter in this context. Secondly, we demonstrate the efficacy of the Transformer models in handling heterogeneous electrode placements, increasing the AUROC to 0.730. Lastly, by incorporating inter-trial variability, we further refine the Transformer models, with an AUROC of 0.745, yielding more consistent predictions across patients. These advancements provide a deeper insight into SOZ localisation and represent a significant step in modelling patient-specific intracranial EEG electrode placements in SPES. Future work will explore integrating these models into clinical decision-making processes to bridge the gap between deep learning research and practical healthcare applications.
- Abstract(参考訳): てんかんは最も一般的な神経疾患の1つであり、多くの患者は発作を制御できない場合に外科的治療を必要とする。
効果的な外科的結果を得るためには、てんかん原性焦点の正確な局所化は、しばしばセイズーレ・オンセット・ゾーン(SOZ)を通して近似されるが、依然として重要な課題である。
電気刺激による能動的プローブは、すでにてんかん原性領域を特定するための標準的な臨床実践である。
本稿では,Single Pulse Electro Stimulation (SPES) 応答を用いたSOZローカライゼーションのための深層学習の応用を推し進める。
チャネル間アテンションを組み込んだTransformerモデルを導入することで、これを実現する。
本研究は, これらのモデルを用いて, 既往の患者に対する汎用性や電極配置の評価を行う。
まず,2つのSPES分析パラダイム,すなわち発散性と収束性を比較するために,既存のディープラーニングモデルを実装した。
これらのパラダイムは、それぞれ外向きと内向きの効果的な接続を評価する。
AUROC:0.574) から収束アプローチ (AUROC: 0.666) への移行において顕著な改善が見られ, この文脈で後者を最初に適用した。
第2に、異種電極配置の処理におけるトランスフォーマーモデルの有効性を示し、AUROCを0.730に増やした。
最後に、心房間変動を取り入れることで、AUROCの0.745でTransformerモデルをさらに洗練し、患者間でより一貫した予測をもたらす。
これらの進歩は、SOZの局在に関する深い洞察を与え、SPESにおける患者固有の頭蓋内脳波電極配置をモデル化する重要なステップを示す。
今後は、これらのモデルを臨床意思決定プロセスに統合して、ディープラーニング研究と実用的な医療応用のギャップを埋めていく予定だ。
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