Fugu-MT 論文翻訳(概要): Automated Text Mining of Experimental Methodologies from Biomedical Literature

論文の概要: Automated Text Mining of Experimental Methodologies from Biomedical Literature

arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.13779v1
Date: Sun, 21 Apr 2024 21:19:36 GMT
ステータス: 処理完了
システム内更新日: 2024-04-23 15:45:49.721127
Title: Automated Text Mining of Experimental Methodologies from Biomedical Literature
Title（参考訳）: バイオメディカル文献による実験手法の自動テキストマイニング
Authors: Ziqing Guo,
Abstract要約: DistilBERTは、生物医学テキストをマイニングするための方法論固有の、事前訓練された生成型分類言語モデルである。言語理解能力においてその効果を証明し、BERTモデルのサイズを40%削減したが、60%高速化した。我々の目標は、この高度に専門化された特定のモデルを異なる研究産業に統合することである。
参考スコア（独自算出の注目度）: 0.087024326813104
License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Abstract: Biomedical literature is a rapidly expanding field of science and technology. Classification of biomedical texts is an essential part of biomedicine research, especially in the field of biology. This work proposes the fine-tuned DistilBERT, a methodology-specific, pre-trained generative classification language model for mining biomedicine texts. The model has proven its effectiveness in linguistic understanding capabilities and has reduced the size of BERT models by 40\% but by 60\% faster. The main objective of this project is to improve the model and assess the performance of the model compared to the non-fine-tuned model. We used DistilBert as a support model and pre-trained on a corpus of 32,000 abstracts and complete text articles; our results were impressive and surpassed those of traditional literature classification methods by using RNN or LSTM. Our aim is to integrate this highly specialised and specific model into different research industries.
Abstract（参考訳）: バイオメディカル文学は、科学と技術の急速に発展する分野である。バイオメディカルテキストの分類は、特に生物学の分野において、生体医学研究の不可欠な部分である。本研究は,バイオメディシンテキストをマイニングするための方法論固有の,事前訓練された生成型分類言語モデルであるDistilBERTを提案する。このモデルは、言語理解能力においてその効果を証明し、BERTモデルのサイズを40\%削減したが、60\%高速化した。このプロジェクトの主な目的は、非微調整モデルと比較してモデルを改善し、モデルの性能を評価することである。筆者らはDistilBertを支援モデルとして使用し,32,000の抽象文と完全テキスト記事のコーパスで事前学習を行った。我々の目標は、この高度に専門化された特定のモデルを異なる研究産業に統合することである。

関連論文リスト

Pre-training data selection for biomedical domain adaptation using journal impact metrics [0.0]
我々は, PubMed トレーニングセットの各種サブセット上で, BERT を継続的に事前学習することにより, 雑誌のインパクト測定と実験を行う。本研究の結果から,ジャーナルインパクトメトリクスを用いたプルーニングは効率的ではないことが示唆された。しかし,より少ない抽象度を用いた事前学習(ただし,同じ数のトレーニングステップで)は,必ずしも結果のモデルの性能を低下させるわけではない。
論文参考訳（メタデータ） (2024-09-04T13:59:48Z)
BioMamba: A Pre-trained Biomedical Language Representation Model Leveraging Mamba [11.012644129839922]
本稿では,生物医学的テキストマイニングに特化した事前学習モデルであるBioMambaを紹介する。実験により、BioMambaは、BioBERTや一般ドメインのMambaなど、様々なバイオメディカルタスクにおいて、かなり優れています。例えば、BioMambaはBioASQテストセットで100倍のパープレキシティ低下と4倍のクロスエントロピー損失を達成している。
論文参考訳（メタデータ） (2024-08-05T16:21:36Z)
Multi-level biomedical NER through multi-granularity embeddings and enhanced labeling [3.8599767910528917]
本稿では,複数のモデルの強みを統合するハイブリッドアプローチを提案する。 BERTは、文脈化された単語の埋め込み、文字レベルの情報キャプチャのための事前訓練されたマルチチャネルCNN、およびテキスト内の単語間の依存関係のシーケンスラベリングとモデル化のためのBiLSTM + CRFを提供する。我々は、ベンチマークi2b2/2010データセットを用いて、F1スコア90.11を達成する。
論文参考訳（メタデータ） (2023-12-24T21:45:36Z)
Diversifying Knowledge Enhancement of Biomedical Language Models using Adapter Modules and Knowledge Graphs [54.223394825528665]
我々は、軽量なアダプターモジュールを用いて、構造化された生体医学的知識を事前訓練された言語モデルに注入するアプローチを開発した。バイオメディカル知識システムUMLSと新しいバイオケミカルOntoChemの2つの大きなKGと、PubMedBERTとBioLinkBERTの2つの著名なバイオメディカルPLMを使用している。計算能力の要件を低く保ちながら,本手法がいくつかの事例において性能改善につながることを示す。
論文参考訳（メタデータ） (2023-12-21T14:26:57Z)
Improving Biomedical Abstractive Summarisation with Knowledge Aggregation from Citation Papers [24.481854035628434]
既存の言語モデルは、バイオメディカルの専門家が生み出したものと同等の技術的要約を生成するのに苦労している。本稿では,引用論文からドメイン固有の知識を統合する,新たな注目に基づく引用集約モデルを提案する。我々のモデルは最先端のアプローチより優れており、抽象的なバイオメディカルテキスト要約の大幅な改善を実現している。
論文参考訳（メタデータ） (2023-10-24T09:56:46Z)
BiomedGPT: A Generalist Vision-Language Foundation Model for Diverse Biomedical Tasks [68.39821375903591]
汎用AIは、さまざまなデータ型を解釈する汎用性のために、制限に対処する可能性を秘めている。本稿では,最初のオープンソースかつ軽量な視覚言語基盤モデルであるBiomedGPTを提案する。
論文参考訳（メタデータ） (2023-05-26T17:14:43Z)
BiomedCLIP: a multimodal biomedical foundation model pretrained from fifteen million scientific image-text pairs [48.376109878173956]
PMC-15Mは,既存のバイオメディカル・マルチモーダル・データセットよりも2桁大きい新しいデータセットである。 PMC-15Mは440万の科学論文から収集された1500万のバイオメディカル画像テキスト対を含んでいる。 PMC-15Mに基づいて,生物医学的視覚言語処理に適したドメイン固有適応を備えた多モーダル基礎モデルであるBiomedCLIPを事前訓練した。
論文参考訳（メタデータ） (2023-03-02T02:20:04Z)
BioGPT: Generative Pre-trained Transformer for Biomedical Text Generation and Mining [140.61707108174247]
本稿では,大規模生物医学文献に基づいて事前学習したドメイン固有生成型トランスフォーマー言語モデルであるBioGPTを提案する。 BC5CDRでは44.98%、38.42%、40.76%のF1スコア、KD-DTIとDDIの関係抽出タスクでは78.2%、PubMedQAでは78.2%の精度が得られた。
論文参考訳（メタデータ） (2022-10-19T07:17:39Z)
On the Effectiveness of Compact Biomedical Transformers [12.432191400869002]
バイオメディカルコーパスで事前訓練された言語モデルは、最近下流のバイオメディカルタスクにおいて有望な結果を示した。既存のトレーニング済みモデルの多くは、埋め込みサイズ、隠れ次元、層数などの要因により、リソース集約的で計算的に重い。本稿では,BioDistilBERT,BioTinyBERT,BioMobileBERT,DistilBioBERT,TinyBioBERT,CompactBioBERTの6つの軽量モデルを紹介する。 3つのバイオメディカルなタスクで全てのモデルを評価し、それらをBioBERT-v1.1と比較し、より大規模なモデルと同等に動作する効率的な軽量モデルを作成する。
論文参考訳（メタデータ） (2022-09-07T14:24:04Z)
Fine-Tuning Large Neural Language Models for Biomedical Natural Language Processing [55.52858954615655]
バイオメディカルNLPの微調整安定性に関する系統的研究を行った。我々は、特に低リソース領域において、微調整性能は事前トレーニング設定に敏感であることを示した。これらの技術は低リソースバイオメディカルNLPアプリケーションの微調整性能を大幅に向上させることができることを示す。
論文参考訳（メタデータ） (2021-12-15T04:20:35Z)
Domain-Specific Language Model Pretraining for Biomedical Natural Language Processing [73.37262264915739]
バイオメディシンなどのラベルなしテキストの少ないドメインでは、スクラッチから言語モデルを事前学習することで、かなりの利益が得られることを示す。実験の結果, ドメイン固有のプレトレーニングは, 幅広い生物医学的NLPタスクの基盤となることが明らかとなった。
論文参考訳（メタデータ） (2020-07-31T00:04:15Z)

関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。

指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト（すべての情報・翻訳含む）の品質を保証せず、本サイト（すべての情報・翻訳含む）を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。