論文の概要: Collaborative Intelligence in Sequential Experiments: A Human-in-the-Loop Framework for Drug Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2405.03942v1
- Date: Tue, 7 May 2024 02:03:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-08 15:38:26.390007
- Title: Collaborative Intelligence in Sequential Experiments: A Human-in-the-Loop Framework for Drug Discovery
- Title（参考訳）: 連続実験における協調的インテリジェンス--創薬のための人間中心のフレームワーク
- Authors: Jinghai He, Cheng Hua, Yingfei Wang, Zeyu Zheng,
- Abstract要約: 本稿では,創薬のシーケンシャルな実験を行うためのHuman-in-the-loopフレームワークを提案する。
提案アルゴリズムは実験データを処理し、有望な分子と、その性能を人間の専門家に改善できる分子の両方を推奨する。
人間の専門家は、これらの推奨事項とドメインの専門知識に基づいて、最終的な意思決定権限を保持します。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 13.438499600701578
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Drug discovery is a complex process that involves sequentially screening and examining a vast array of molecules to identify those with the target properties. This process, also referred to as sequential experimentation, faces challenges due to the vast search space, the rarity of target molecules, and constraints imposed by limited data and experimental budgets. To address these challenges, we introduce a human-in-the-loop framework for sequential experiments in drug discovery. This collaborative approach combines human expert knowledge with deep learning algorithms, enhancing the discovery of target molecules within a specified experimental budget. The proposed algorithm processes experimental data to recommend both promising molecules and those that could improve its performance to human experts. Human experts retain the final decision-making authority based on these recommendations and their domain expertise, including the ability to override algorithmic recommendations. We applied our method to drug discovery tasks using real-world data and found that it consistently outperforms all baseline methods, including those which rely solely on human or algorithmic input. This demonstrates the complementarity between human experts and the algorithm. Our results provide key insights into the levels of humans' domain knowledge, the importance of meta-knowledge, and effective work delegation strategies. Our findings suggest that such a framework can significantly accelerate the development of new vaccines and drugs by leveraging the best of both human and artificial intelligence.
- Abstract（参考訳）: 薬物発見は複雑なプロセスであり、標的となる性質を持つ分子を連続的にスクリーニングし、分析する。
このプロセスはシーケンシャルな実験とも呼ばれ、膨大な探索空間、標的分子の希少性、限られたデータと実験予算によって課される制約による課題に直面している。
これらの課題に対処するために,創薬のシーケンシャルな実験を行うためのHuman-in-the-loopフレームワークを提案する。
この協調的なアプローチは、人間の専門家の知識とディープラーニングアルゴリズムを組み合わせることで、特定の実験予算内で標的分子の発見を促進する。
提案アルゴリズムは実験データを処理し、有望な分子と、その性能を人間の専門家に改善できる分子の両方を推奨する。
人間の専門家は、これらのレコメンデーションと、アルゴリズムのレコメンデーションをオーバーライドする機能を含むドメインの専門知識に基づいて、最終的な意思決定権限を保持します。
実世界のデータを用いた薬物発見タスクに本手法を適用し,人間やアルゴリズムにのみ依存するものを含む,すべての基本手法を一貫して上回っていることを確認した。
これは、人間の専門家とアルゴリズムの相補性を示す。
その結果,人間のドメイン知識のレベル,メタ知識の重要性,効果的な作業委譲戦略に関する重要な知見が得られた。
これらの枠組みは,人的・人工知能の長所を生かして,新たなワクチンや医薬品の開発を著しく加速する可能性が示唆された。
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