論文の概要: Automatic segmentation of Organs at Risk in Head and Neck cancer patients from CT and MRI scans
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2405.10833v3
- Date: Thu, 04 Sep 2025 19:01:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-08 14:27:24.993282
- Title: Automatic segmentation of Organs at Risk in Head and Neck cancer patients from CT and MRI scans
- Title(参考訳): CTおよびMRIによる頭頸部癌リスク臓器の自動分別
- Authors: Sébastien Quetin, Andrew Heschl, Mauricio Murillo, Rohit Murali, Piotr Pater, George Shenouda, Shirin A. Enger, Farhad Maleki,
- Abstract要約: 296例のCTとMRI-T1で分画パイプラインを訓練した。
パイプラインはHaN-Segチャレンジで78.12%、HD3.42mmで最先端のパフォーマンスを達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.215938932388722
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Purpose: To present a high-performing, robust, and flexible deep learning pipeline for automatic segmentation of 30 organs-at-risk (OARs) in head and neck (H&N) cancer patients, using MRI, CT, or both. Method: We trained a segmentation pipeline on paired CT and MRI-T1 scans from 296 patients. We combined data from the H&N OARs CT and MR segmentation (HaN-Seg) challenge and the Burdenko and GLIS-RT datasets from the Cancer Imaging Archive (TCIA). MRI was rigidly registered to CT, and both were stacked as input to an nnU-Net pipeline. Left and right OARs were merged into single classes during training and separated at inference time based on anatomical position. Modality Dropout was applied during the training, ensuring the model would learn from both modalities and robustly handle missing modalities during inference. The trained model was evaluated on the HaN-Seg test set and three TCIA datasets. Predictions were also compared with Limbus AI software. Dice Score (DS) and Hausdorff Distance (HD) were used as evaluation metrics. Results: The pipeline achieved state-of-the-art performance on the HaN-Seg challenge with a mean DS of 78.12% and HD of 3.42 mm. On TCIA datasets, the model maintained strong agreement with Limbus AI software (DS: 77.43% , HD: 3.27 mm), while also flagging low-quality contours. The pipeline can segment seamlessly from the CT, the MRI scan, or both. Conclusion: The proposed pipeline achieved the best DS and HD scores among all HaN-Seg challenge participants and establishes a new state-of-the-art for fully automated, multi-modal segmentation of H&N OARs.
- Abstract(参考訳): 目的: 頭頸部癌(H&N)患者30臓器(OAR)をMRI, CT, またはその両方で自動分割するための高性能で堅牢で柔軟な深層学習パイプラインを提供する。
方法: 296例のCTとMRI-T1スキャンでセグメンテーションパイプラインを訓練した。
我々は,H&N OARs CTとMRセグメンテーション(HaN-Seg)の課題から得られたデータと,がん画像アーカイブ(TCIA)のBurdenkoとGLIS-RTデータセットを組み合わせた。
MRIはCTに厳格に登録され、どちらもnnU-Netパイプラインへの入力として積み上げられた。
左右のOARは訓練中に単一クラスにマージされ,解剖学的位置に基づいて推論時に分離された。
モダリティ・ドロップアウトはトレーニング中に適用され、モデルが両方のモダリティから学習し、推論中に欠落したモダリティを堅牢に扱うことが保証された。
トレーニングされたモデルは、HaN-Segテストセットと3つのCIAデータセットで評価された。
予測はLimbus AIソフトウェアと比較された。
Dice Score (DS) と Hausdorff Distance (HD) が評価指標として用いられた。
結果: パイプラインはHaN-Segチャレンジにおいて、平均DSは78.12%、HDは3.42mmで最先端のパフォーマンスを達成した。
TCIAデータセットでは、このモデルはLimbus AIソフトウェア(DS: 77.43%、HD: 3.27 mm)との強い合意を維持し、低品質な輪郭もフラグ付けした。
パイプラインは、CT、MRIスキャン、あるいはその両方からシームレスにセグメント化できる。
結論: 提案したパイプラインは,すべてのHaN-Segチャレンジ参加者の中で最高のDSとHDスコアを獲得し,H&N OARの完全自動マルチモーダルセグメンテーションのための新たな最先端技術を確立する。
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