論文の概要: MolFusion: Multimodal Fusion Learning for Molecular Representations via Multi-granularity Views
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.18020v1
- Date: Wed, 26 Jun 2024 02:26:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-27 14:57:54.656368
- Title: MolFusion: Multimodal Fusion Learning for Molecular Representations via Multi-granularity Views
- Title(参考訳): MolFusion:マルチグラニュラビューによる分子表現のためのマルチモーダル融合学習
- Authors: Muzhen Cai, Sendong Zhao, Haochun Wang, Yanrui Du, Zewen Qiang, Bing Qin, Ting Liu,
- Abstract要約: 分子多量性を組み合わせた多粒性融合法を提案する。
MolFusionは分子レベルのエンコーディングコンポーネントであるMollSimと、原子レベルのエンコーディングコンポーネントであるAtomAlignの2つの重要なコンポーネントで構成されている。
その結果,MolFusionは補完的なマルチモーダル情報を効果的に活用し,性能が大幅に向上した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 25.69424590542192
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Artificial Intelligence predicts drug properties by encoding drug molecules, aiding in the rapid screening of candidates. Different molecular representations, such as SMILES and molecule graphs, contain complementary information for molecular encoding. Thus exploiting complementary information from different molecular representations is one of the research priorities in molecular encoding. Most existing methods for combining molecular multi-modalities only use molecular-level information, making it hard to encode intra-molecular alignment information between different modalities. To address this issue, we propose a multi-granularity fusion method that is MolFusion. The proposed MolFusion consists of two key components: (1) MolSim, a molecular-level encoding component that achieves molecular-level alignment between different molecular representations. and (2) AtomAlign, an atomic-level encoding component that achieves atomic-level alignment between different molecular representations. Experimental results show that MolFusion effectively utilizes complementary multimodal information, leading to significant improvements in performance across various classification and regression tasks.
- Abstract(参考訳): 人工知能は、薬物分子をコードし、候補の迅速なスクリーニングを支援することによって、薬物の性質を予測する。
SMILESや分子グラフのような異なる分子表現は、分子エンコーディングのための相補的な情報を含んでいる。
したがって、異なる分子表現から相補的な情報を活用することは、分子エンコーディングにおける研究の優先事項の1つである。
分子多量体を結合するほとんどの方法では分子レベルの情報しか使用せず、分子内アライメント情報を異なるモダリティ間でエンコードすることが困難である。
この問題に対処するため,MolFusion と呼ばれる多粒性融合法を提案する。
提案したMollFusionは,(1)分子レベルで異なる分子表現間の分子レベルのアライメントを実現する分子レベルのコード化コンポーネントであるMollSimの2つの主要成分から構成される。
AtomAlignは、異なる分子表現間の原子レベルアライメントを実現する原子レベルエンコーディングコンポーネントである。
実験結果から,MolFusionは相補的マルチモーダル情報を効果的に活用し,様々な分類タスクや回帰タスクにおいて性能が大幅に向上することが示された。
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