論文の概要: Generative models of MRI-derived neuroimaging features and associated dataset of 18,000 samples
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.12897v2
- Date: Tue, 01 Oct 2024 17:26:18 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-02 16:32:11.134219
- Title: Generative models of MRI-derived neuroimaging features and associated dataset of 18,000 samples
- Title(参考訳): MRI誘発神経画像の特徴と18,000サンプルの関連データセットの生成モデル
- Authors: Sai Spandana Chintapalli, Rongguang Wang, Zhijian Yang, Vasiliki Tassopoulou, Fanyang Yu, Vishnu Bashyam, Guray Erus, Pratik Chaudhari, Haochang Shou, Christos Davatzikos,
- Abstract要約: GenMINDは、構造的脳画像から派生した規範的地域容積特徴の生成モデルである。
成人の寿命(22~90歳)にまたがる18,000の合成サンプルと、無制限のデータを生成するモデルの能力を提供する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 17.576301478946775
- License:
- Abstract: Availability of large and diverse medical datasets is often challenged by privacy and data sharing restrictions. For successful application of machine learning techniques for disease diagnosis, prognosis, and precision medicine, large amounts of data are necessary for model building and optimization. To help overcome such limitations in the context of brain MRI, we present GenMIND: a collection of generative models of normative regional volumetric features derived from structural brain imaging. GenMIND models are trained on real brain imaging regional volumetric measures from the iSTAGING consortium, which encompasses over 40,000 MRI scans across 13 studies, incorporating covariates such as age, sex, and race. Leveraging GenMIND, we produce and offer 18,000 synthetic samples spanning the adult lifespan (ages 22-90 years), alongside the model's capability to generate unlimited data. Experimental results indicate that samples generated from GenMIND agree with the distributions obtained from real data. Most importantly, the generated normative data significantly enhance the accuracy of downstream machine learning models on tasks such as disease classification. Data and models are available at: https://huggingface.co/spaces/rongguangw/GenMIND.
- Abstract(参考訳): 大規模で多様な医療データセットの可用性は、プライバシとデータ共有の制限によってしばしば問題になる。
機械学習技術の病気診断、予後診断、精密医療への応用を成功させるためには、モデルの構築と最適化に大量のデータが必要である。
脳MRIの文脈におけるそのような限界を克服するために、構造的脳画像から派生した規範的局所容積特徴の生成モデルであるGenMINDを提示する。
GenMINDモデルは、13の研究で4万以上のMRIスキャンを網羅し、年齢、性別、人種などの共変量を含むiSTAGINGコンソーシアムから、実際の脳画像領域の体積測定に基づいて訓練されている。
GenMINDを活用することで、成人の寿命(22~90歳)にまたがる18,000の合成サンプルを作成、提供し、モデルが無制限のデータを生成する能力とともに提供する。
実験の結果,GenMINDから生成されたサンプルは実データから得られた分布と一致していることがわかった。
最も重要なことは、生成された規範データにより、疾患分類などのタスクにおける下流機械学習モデルの精度が大幅に向上することである。
データとモデルは、https://huggingface.co/spaces/rongguangw/GenMIND.comで入手できる。
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