論文の概要: ${\it Asparagus}$: A Toolkit for Autonomous, User-Guided Construction of Machine-Learned Potential Energy Surfaces
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.15175v1
- Date: Sun, 21 Jul 2024 14:22:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-23 18:59:03.846126
- Title: ${\it Asparagus}$: A Toolkit for Autonomous, User-Guided Construction of Machine-Learned Potential Energy Surfaces
- Title（参考訳）: ${\it Asparagus}$: 機械学習型ポテンシャルエネルギー表面の自律的ユーザガイド構築のためのツールキット
- Authors: Kai Töpfer, Luis Itza Vazquez-Salazar, Markus Meuwly,
- Abstract要約: $it Asparagus$は、ML-PESモデルの自律的ユーザガイド構築を可能にする、複数のパーツを一貫した実装に包含するソフトウェアパッケージである。
コードの機能については、有機金属化合物における反応性ポテンシャルの表現や周期的な表面構造への原子拡散など、様々な例で説明されている。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: With the establishment of machine learning (ML) techniques in the scientific community, the construction of ML potential energy surfaces (ML-PES) has become a standard process in physics and chemistry. So far, improvements in the construction of ML-PES models have been conducted independently, creating an initial hurdle for new users to overcome and complicating the reproducibility of results. Aiming to reduce the bar for the extensive use of ML-PES, we introduce ${\it Asparagus}$, a software package encompassing the different parts into one coherent implementation that allows an autonomous, user-guided construction of ML-PES models. ${\it Asparagus}$ combines capabilities of initial data sampling with interfaces to ${\it ab initio}$ calculation programs, ML model training, as well as model evaluation and its application within other codes such as ASE or CHARMM. The functionalities of the code are illustrated in different examples, including the dynamics of small molecules, the representation of reactive potentials in organometallic compounds, and atom diffusion on periodic surface structures. The modular framework of ${\it Asparagus}$ is designed to allow simple implementations of further ML-related methods and models to provide constant user-friendly access to state-of-the-art ML techniques.
- Abstract（参考訳）: 科学コミュニティにおける機械学習(ML)技術の確立により、MLポテンシャルエネルギー面(ML-PES)の構築は物理学や化学の標準的プロセスとなっている。
これまでのところ、ML-PESモデルの構築は独立して行われており、新しいユーザーが結果の再現性を克服し、複雑化する最初のハードルとなっている。
ML-PESを広範囲に使用するためのバーを減らすため,我々は,ML-PESモデルの自律的かつユーザガイドによる構築を可能にする,さまざまな部分を一貫した実装に包含するソフトウェアパッケージである${\it Asparagus}$を紹介した。
${\it Asparagus}$は、初期データサンプリングの機能をインターフェースと組み合わせて、${\it ab initio}$計算プログラム、MLモデルのトレーニング、モデルの評価と、ASEやCHARMMといった他のコードへの適用などを行います。
コードの機能については、小さな分子のダイナミクス、有機金属化合物の反応性ポテンシャルの表現、周期的な表面構造への原子拡散など、様々な例で説明されている。
The modular framework of ${\it Asparagus}$ is designed to allow simple implementation of further ML-related method and model to provide constant user- friendly access to the-of-the-the-art ML techniques。
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