論文の概要: Leaf Angle Estimation using Mask R-CNN and LETR Vision Transformer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.00749v1
- Date: Thu, 1 Aug 2024 17:52:10 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-04 19:37:48.240319
- Title: Leaf Angle Estimation using Mask R-CNN and LETR Vision Transformer
- Title(参考訳): Mask R-CNN と LETR Vision Transformer を用いた葉角推定
- Authors: Venkat Margapuri, Prapti Thapaliya, Trevor Rife,
- Abstract要約: 現代の研究では、高収量作物品種と直立葉角の植物との間に高い相関関係が示されている。
直立葉角を持つ植物は直立葉角を持たない植物よりも多くの光を遮断し、光合成の速度が高まることが観察された。
植物科学者や育種者は、現場の植物パラメータを直接測定できるツール、即ち現場での表現型化の恩恵を受ける。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Modern day studies show a high degree of correlation between high yielding crop varieties and plants with upright leaf angles. It is observed that plants with upright leaf angles intercept more light than those without upright leaf angles, leading to a higher rate of photosynthesis. Plant scientists and breeders benefit from tools that can directly measure plant parameters in the field i.e. on-site phenotyping. The estimation of leaf angles by manual means in a field setting is tedious and cumbersome. We mitigate the tedium using a combination of the Mask R-CNN instance segmentation neural network, and Line Segment Transformer (LETR), a vision transformer. The proposed Computer Vision (CV) pipeline is applied on two image datasets, Summer 2015-Ames ULA and Summer 2015- Ames MLA, with a combined total of 1,827 plant images collected in the field using FieldBook, an Android application aimed at on-site phenotyping. The leaf angles estimated by the proposed pipeline on the image datasets are compared to two independent manual measurements using ImageJ, a Java-based image processing program developed at the National Institutes of Health and the Laboratory for Optical and Computational Instrumentation. The results, when compared for similarity using the Cosine Similarity measure, exhibit 0.98 similarity scores on both independent measurements of Summer 2015-Ames ULA and Summer 2015-Ames MLA image datasets, demonstrating the feasibility of the proposed pipeline for on-site measurement of leaf angles.
- Abstract(参考訳): 現代の研究では、高収量作物品種と直立葉角の植物との間に高い相関関係が示されている。
直立葉角を持つ植物は直立葉角を持たない植物よりも多くの光を遮断し、光合成の速度が高まることが観察された。
植物科学者や育種者は、現場の植物パラメータを直接測定できるツール、即ち現場での表現型化の恩恵を受ける。
フィールド設定における手動手段による葉角の推定は面倒で面倒である。
我々は、Mask R-CNNインスタンスセグメンテーションニューラルネットワークとビジョントランスであるLine Segment Transformer(LETR)を組み合わせて、テジウムを緩和する。
提案されたComputer Vision(CV)パイプラインは、2015年夏-Ames ULAと2015年夏-Ames MLAの2つのイメージデータセットに適用される。
提案した画像データセット上の葉の角度を,国立衛生研究所と光学・計算機器研究所で開発されたJavaベースの画像処理プログラムであるImageJを用いて,2つの独立した手動計測値と比較した。
その結果、コサイン類似度測定を用いて類似度を比較すると、2015年夏-Ames ULAと2015年夏-Ames MLAの画像データセットの双方の独立測定で0.98の類似度スコアを示し、葉の角度のオンサイト測定に提案されたパイプラインの有効性を実証した。
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