論文の概要: MolTRES: Improving Chemical Language Representation Learning for Molecular Property Prediction

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.01426v1
• Date: Tue, 9 Jul 2024 01:14:28 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2024-08-19 05:08:48.020631
• Title: MolTRES: Improving Chemical Language Representation Learning for Molecular Property Prediction
• Title（参考訳）: MolTRES:分子特性予測のための化学言語表現学習の改善
• Authors: Jun-Hyung Park, Yeachan Kim, Mingyu Lee, Hyuntae Park, SangKeun Lee,
• Abstract要約: MolTRESは化学言語表現学習フレームワークである。 ジェネレータと識別器のトレーニングが組み込まれており、より難しい例からモデルを学習することができる。 我々のモデルは、一般的な分子特性予測タスクにおける既存の最先端モデルよりも優れています。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 14.353313239109337
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Chemical representation learning has gained increasing interest due to the limited availability of supervised data in fields such as drug and materials design. This interest particularly extends to chemical language representation learning, which involves pre-training Transformers on SMILES sequences -- textual descriptors of molecules. Despite its success in molecular property prediction, current practices often lead to overfitting and limited scalability due to early convergence. In this paper, we introduce a novel chemical language representation learning framework, called MolTRES, to address these issues. MolTRES incorporates generator-discriminator training, allowing the model to learn from more challenging examples that require structural understanding. In addition, we enrich molecular representations by transferring knowledge from scientific literature by integrating external materials embedding. Experimental results show that our model outperforms existing state-of-the-art models on popular molecular property prediction tasks.
• Abstract（参考訳）: 化学表現学習は、薬物や材料設計などの分野における教師付きデータの利用が限られているため、関心が高まっている。 この関心は特に化学言語表現学習にまで広がり、SMILES配列上のトランスフォーマー -- 分子のテキスト記述子 -- を事前学習する。 分子特性予測の成功にもかかわらず、現在のプラクティスはしばしば初期の収束によって過度に適合し、スケーラビリティが制限される。 本稿では,これらの問題に対処するために,MolTRESと呼ばれる新しい化学言語表現学習フレームワークを提案する。 MolTRESはジェネレータと識別器のトレーニングを取り入れており、構造的理解を必要とするより難しい例からモデルを学習することができる。 さらに, 外部材料を埋め込むことにより, 科学文献から知識を伝達することで分子表現を充実させる。 実験結果から,本モデルは分子特性予測タスクにおける既存の最先端モデルよりも優れていることがわかった。

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