論文の概要: Parallel Algorithms for Median Consensus Clustering in Complex Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.11331v1
- Date: Wed, 21 Aug 2024 04:27:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-22 18:28:56.235126
- Title: Parallel Algorithms for Median Consensus Clustering in Complex Networks
- Title(参考訳): 複雑なネットワークにおけるメディアコンセンサスクラスタリングのための並列アルゴリズム
- Authors: Md Taufique Hussain, Mahantesh Halappanavar, Samrat Chatterjee, Filippo Radicchi, Santo Fortunato, Ariful Azad,
- Abstract要約: 我々は,グラフの多数の異なるクラスタリングソリューションのコンセンサスを求めるアルゴリズムを開発した。
我々のアルゴリズムはグラフ構造を考慮に入れ、他の手法よりもはるかに高速な品質の解を求める。
並列アルゴリズムは,64コアを大規模実世界のグラフに利用することにより,35倍の高速化を実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.7474428734943532
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We develop an algorithm that finds the consensus of many different clustering solutions of a graph. We formulate the problem as a median set partitioning problem and propose a greedy optimization technique. Unlike other approaches that find median set partitions, our algorithm takes graph structure into account and finds a comparable quality solution much faster than the other approaches. For graphs with known communities, our consensus partition captures the actual community structure more accurately than alternative approaches. To make it applicable to large graphs, we remove sequential dependencies from our algorithm and design a parallel algorithm. Our parallel algorithm achieves 35x speedup when utilizing 64 processing cores for large real-world graphs from single-cell experiments.
- Abstract(参考訳): 我々は,グラフの多数の異なるクラスタリングソリューションのコンセンサスを求めるアルゴリズムを開発した。
この問題を中央値集合分割問題として定式化し、グリーディ最適化手法を提案する。
中央値集合分割を求める他の手法とは異なり、我々のアルゴリズムはグラフ構造を考慮に入れ、他の手法よりもはるかに高速な品質解を求める。
既知のコミュニティを持つグラフでは、コンセンサスパーティションは、代替アプローチよりも正確なコミュニティ構造をキャプチャします。
大規模グラフに適用するために,アルゴリズムから逐次依存関係を取り除き,並列アルゴリズムを設計する。
並列アルゴリズムは,64個の処理コアを単一セル実験による大規模実世界のグラフに利用することにより,35倍の高速化を実現する。
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