論文の概要: Unsupervised discovery of the shared and private geometry in multi-view data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2408.12091v1
- Date: Thu, 22 Aug 2024 03:00:21 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-23 15:23:41.561798
- Title: Unsupervised discovery of the shared and private geometry in multi-view data
- Title(参考訳): 多視点データにおける共有・私的幾何学の教師なし発見
- Authors: Sai Koukuntla, Joshua B. Julian, Jesse C. Kaminsky, Manuel Schottdorf, David W. Tank, Carlos D. Brody, Adam S. Charles,
- Abstract要約: 我々は低次元の共有変数とプライベート潜伏変数をアンハングリングする非線形ニューラルネットワークに基づく手法を開発した。
我々は,異なる雑音条件で解釈可能な共有構造とプライベート構造を探索するモデルの能力を実証する。
本手法を海馬と前頭前皮質の同時記録に応用し, マウスが直線軌道を走行している間に, 動物の位置を符号化する低次元の潜伏空間を発見する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.8816600430294537
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Modern applications often leverage multiple views of a subject of study. Within neuroscience, there is growing interest in large-scale simultaneous recordings across multiple brain regions. Understanding the relationship between views (e.g., the neural activity in each region recorded) can reveal fundamental principles about the characteristics of each representation and about the system. However, existing methods to characterize such relationships either lack the expressivity required to capture complex nonlinearities, describe only sources of variance that are shared between views, or discard geometric information that is crucial to interpreting the data. Here, we develop a nonlinear neural network-based method that, given paired samples of high-dimensional views, disentangles low-dimensional shared and private latent variables underlying these views while preserving intrinsic data geometry. Across multiple simulated and real datasets, we demonstrate that our method outperforms competing methods. Using simulated populations of lateral geniculate nucleus (LGN) and V1 neurons we demonstrate our model's ability to discover interpretable shared and private structure across different noise conditions. On a dataset of unrotated and corresponding but randomly rotated MNIST digits, we recover private latents for the rotated view that encode rotation angle regardless of digit class, and places the angle representation on a 1-d manifold, while shared latents encode digit class but not rotation angle. Applying our method to simultaneous Neuropixels recordings of hippocampus and prefrontal cortex while mice run on a linear track, we discover a low-dimensional shared latent space that encodes the animal's position. We propose our approach as a general-purpose method for finding succinct and interpretable descriptions of paired data sets in terms of disentangled shared and private latent variables.
- Abstract(参考訳): 現代の応用は、しばしば研究対象の複数の視点を利用する。
神経科学では、複数の脳領域にまたがる大規模な同時記録への関心が高まっている。
ビュー間の関係(例えば、各領域の神経活動)を理解することは、各表現の特徴とシステムに関する基本的な原則を明らかにすることができる。
しかし、そのような関係を特徴づける既存の方法は、複雑な非線形性を捉えるのに必要な表現性を欠くか、ビュー間で共有される分散の源のみを記述するか、データの解釈に不可欠な幾何学的情報を捨てるかのいずれかである。
そこで本研究では,高次元ビューのペア化されたサンプルを与えられた非線形ニューラルネットワークを用いて,これらのビューの基盤となる低次元の共有変数とプライベート変数を分離し,本質的なデータ幾何を保存する。
複数のシミュレートされた実データにまたがって,本手法が競合する手法よりも優れていることを示す。
側方生成核(LGN)とV1ニューロンの模擬集団を用いて、異なるノイズ条件で解釈可能な共有構造とプライベート構造を発見する能力を示す。
回転しないが無作為に回転するMNIST桁のデータセット上では、回転する図形に対して、回転する図形に対して回転角を符号化し、1-d多様体上に角度表現を配置する。
本手法を海馬と前頭前皮質の同時記録に応用し, マウスが直線軌道を走行している間に, 動物の位置を符号化する低次元の潜伏空間を発見する。
本稿では,ペア化データセットの簡潔かつ解釈可能な記述を,非絡み合わされた共有変数とプライベート潜伏変数の観点から検索する汎用的手法として提案する。
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