論文の概要: Automated Body Composition Analysis Using DAFS Express on 2D MRI Slices at L3 Vertebral Level
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.06942v1
- Date: Wed, 11 Sep 2024 01:46:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-12 15:57:17.718302
- Title: Automated Body Composition Analysis Using DAFS Express on 2D MRI Slices at L3 Vertebral Level
- Title(参考訳): L3脳レベルでの2次元MRIスライス上でのDAFSエクスプレスを用いた体組成自動解析
- Authors: Varun Akella, Razeyeh Bagherinasab, Jia Ming Li, Long Nguyen, Vincent Tze Yang Chow, Hyunwoo Lee, Karteek Popuri, Mirza Faisal Beg,
- Abstract要約: 体組成分析は肥満、サルコニア、メタボリックシンドロームなどの健康状態を評価する上で不可欠である。MRIは骨格筋(SKM)、内臓脂肪組織(VAT)、皮下脂肪組織(SAT)の詳細な画像を提供する。
本研究では,MRIによる2次元体組成解析のための自動ツールについて検証する(データ解析スイート(DAFS)エクスプレス)。
SKM 99.03%、VAT 95.25%、SAT 99.57%、平均ディススコア:SKM 99.51%、VAT 97.41%、SAT 99.78%である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.9995074627389677
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Body composition analysis is vital in assessing health conditions such as obesity, sarcopenia, and metabolic syndromes. MRI provides detailed images of skeletal muscle (SKM), visceral adipose tissue (VAT), and subcutaneous adipose tissue (SAT), but their manual segmentation is labor-intensive and limits clinical applicability. This study validates an automated tool for MRI-based 2D body composition analysis- (Data Analysis Facilitation Suite (DAFS) Express), comparing its automated measurements with expert manual segmentations using UK Biobank data. A cohort of 399 participants from the UK Biobank dataset was selected, yielding 423 single L3 slices for analysis. DAFS Express performed automated segmentations of SKM, VAT, and SAT, which were then manually corrected by expert raters for validation. Evaluation metrics included Jaccard coefficients, Dice scores, Intraclass Correlation Coefficients (ICCs), and Bland-Altman Plots to assess segmentation agreement and reliability. High agreements were observed between automated and manual segmentations with mean Jaccard scores: SKM 99.03%, VAT 95.25%, and SAT 99.57%; and mean Dice scores: SKM 99.51%, VAT 97.41%, and SAT 99.78%. Cross-sectional area comparisons showed consistent measurements with automated methods closely matching manual measurements for SKM and SAT, and slightly higher values for VAT (SKM: Auto 132.51 cm^2, Manual 132.36 cm^2; VAT: Auto 137.07 cm^2, Manual 134.46 cm^2; SAT: Auto 203.39 cm^2, Manual 202.85 cm^2). ICCs confirmed strong reliability (SKM: 0.998, VAT: 0.994, SAT: 0.994). Bland-Altman plots revealed minimal biases, and boxplots illustrated distribution similarities across SKM, VAT, and SAT areas. On average DAFS Express took 18 seconds per DICOM. This underscores its potential to streamline image analysis processes in research and clinical settings, enhancing diagnostic accuracy and efficiency.
- Abstract(参考訳): 体組成分析は肥満、サルコニア、メタボリックシンドロームなどの健康状態を評価する上で不可欠である。
MRIは、骨格筋(SKM)、内臓脂肪組織(VAT)、皮下脂肪組織(SAT)の詳細な画像を提供するが、手動分割は労働集約的で臨床応用性に制限がある。
本研究では,MRIを用いた2次元ボディコンポジション分析のための自動ツールであるDAFS(Data Analysis Facilitation Suite) Expressの検証を行い,その自動測定と英国バイオバンクのデータを用いた手動セグメンテーションの比較を行った。
UK Biobankデータセットから399人の参加者からなるコホートが選択され、分析のために423個のL3スライスを得た。
DAFS ExpressはSKM、VAT、SATの自動セグメンテーションを実行し、検証のために専門家による手作業で修正した。
評価指標は,ジャカード係数,Diceスコア,クラス内相関係数(ICC),Bland-Altman Plotsで,セグメンテーション合意と信頼性を評価した。
SKM 99.03%、VAT 95.25%、SAT 99.57%、Dice 99.51%、VAT 97.41%、SAT 99.78%である。
断面積の比較では、SKMとSATのマニュアル測定と密に一致した自動測定方法と一致しており、VAT(SKM: Auto 132.51 cm^2, Manual 132.36 cm^2; VAT: Auto 137.07 cm^2, Manual 134.46 cm^2; SAT: Auto 203.39 cm^2, Manual 202.85 cm^2; VAT: Auto 137.07 cm^2, Manual 134.46 cm^2; SAT: Auto 203.39 cm^2, Manual 202.85 cm^2)の値はわずかに高い。
ICCは強い信頼性(SKM:0.998、VAT:0.994、SAT:0.994)を確認した。
Bland-Altmanプロットは最小バイアスを示し、ボックスプロットはSKM, VAT, SAT領域の分布類似性を示した。
DAFS ExpressはDICOMあたり平均18秒を要した。
このことは、研究と臨床における画像解析プロセスの合理化の可能性を強調し、診断精度と効率を向上させる。
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