論文の概要: Generating Synthetic Free-text Medical Records with Low Re-identification Risk using Masked Language Modeling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.09831v3
- Date: Wed, 29 Jan 2025 23:10:09 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-31 15:13:04.282436
- Title: Generating Synthetic Free-text Medical Records with Low Re-identification Risk using Masked Language Modeling
- Title（参考訳）: マスケッド言語モデリングを用いた低再同定リスクを有する合成自由テキスト医療記録の生成
- Authors: Samuel Belkadi, Libo Ren, Nicolo Micheletti, Lifeng Han, Goran Nenadic,
- Abstract要約: Masked Language Modeling を用いた合成自由テキスト医療記録生成システムを提案する。
このシステムは、世代ごとの多様性を導入しつつ、重要な医療情報を保存し、再識別リスクを最小限にする。
その結果,HIPAA準拠のPHIリコール率96%,再同定リスク3.5%で高品質な合成データが得られた。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 6.193782515824411
- License:
- Abstract: The vast amount of available medical records has the potential to improve healthcare and biomedical research. However, privacy restrictions make these data accessible for internal use only. Recent works have addressed this problem by generating synthetic data using Causal Language Modeling. Unfortunately, by taking this approach, it is often impossible to guarantee patient privacy while offering the ability to control the diversity of generations without increasing the cost of generating such data. In contrast, we present a system for generating synthetic free-text medical records using Masked Language Modeling. The system preserves critical medical information while introducing diversity in the generations and minimising re-identification risk. The system's size is about 120M parameters, minimising inference cost. The results demonstrate high-quality synthetic data with a HIPAA-compliant PHI recall rate of 96% and a re-identification risk of 3.5%. Moreover, downstream evaluations show that the generated data can effectively train a model with performance comparable to real data.
- Abstract（参考訳）: 利用可能な医療記録の膨大な量は、医療と生物医学の研究を改善する可能性がある。
しかし、プライバシーの制限により、これらのデータは内部でのみ利用できるようになる。
最近の研究は、因果言語モデリングを用いて合成データを生成することでこの問題に対処している。
残念ながら、このアプローチを採用することで、そのようなデータを生成するコストを増大させることなく、世代間の多様性を制御する能力を提供しながら、患者のプライバシを保証することは不可能であることが多い。
対照的に、マスケッド言語モデリングを用いて、合成自由テキスト医療記録を生成するシステムを提案する。
このシステムは、世代ごとの多様性を導入しつつ、重要な医療情報を保存し、再識別リスクを最小限にする。
システムのサイズは約120万のパラメータであり、推論コストを最小化している。
その結果,HIPAA準拠のPHIリコール率96%,再同定リスク3.5%で高品質な合成データが得られた。
さらに、下流評価では、生成されたデータが実データに匹敵するパフォーマンスでモデルを効果的に訓練できることが示されている。
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