論文の概要: Clinical Validation of a Real-Time Machine Learning-based System for the Detection of Acute Myeloid Leukemia by Flow Cytometry
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.11350v1
- Date: Tue, 17 Sep 2024 16:53:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-09-18 15:37:15.536136
- Title: Clinical Validation of a Real-Time Machine Learning-based System for the Detection of Acute Myeloid Leukemia by Flow Cytometry
- Title(参考訳): フローサイトメトリーによる急性骨髄性白血病検出のためのリアルタイム機械学習システムの臨床的検討
- Authors: Lauren M. Zuromski, Jacob Durtschi, Aimal Aziz, Jeffrey Chumley, Mark Dewey, Paul English, Muir Morrison, Keith Simmon, Blaine Whipple, Brendan O'Fallon, David P. Ng,
- Abstract要約: フロー内の機械学習(ML)モデルは、エラー率を低減し、効率を向上し、臨床実験室の効率を向上する可能性がある。
このようなモデルの臨床的展開についてはほとんど研究されていない。
急性骨髄性白血病(AML)の検出のためのMLモデルと臨床実装を支えるインフラについて述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Machine-learning (ML) models in flow cytometry have the potential to reduce error rates, increase reproducibility, and boost the efficiency of clinical labs. While numerous ML models for flow cytometry data have been proposed, few studies have described the clinical deployment of such models. Realizing the potential gains of ML models in clinical labs requires not only an accurate model, but infrastructure for automated inference, error detection, analytics and monitoring, and structured data extraction. Here, we describe an ML model for detection of Acute Myeloid Leukemia (AML), along with the infrastructure supporting clinical implementation. Our infrastructure leverages the resilience and scalability of the cloud for model inference, a Kubernetes-based workflow system that provides model reproducibility and resource management, and a system for extracting structured diagnoses from full-text reports. We also describe our model monitoring and visualization platform, an essential element for ensuring continued model accuracy. Finally, we present a post-deployment analysis of impacts on turn-around time and compare production accuracy to the original validation statistics.
- Abstract(参考訳): フローサイトメトリーにおける機械学習(ML)モデルは、エラー率を減らし、再現性を高め、臨床実験室の効率を高める可能性がある。
フローサイトメトリーデータのための多くのMLモデルが提案されているが、そのようなモデルの臨床的展開についてはほとんど研究されていない。
臨床実験室におけるMLモデルの潜在的な利益を実現するには、正確なモデルだけでなく、自動推論、エラー検出、分析とモニタリング、構造化データ抽出のためのインフラが必要である。
本稿では,急性骨髄性白血病(AML)の検出のためのMLモデルについて述べる。
私たちのインフラストラクチャは、モデル推論のためのクラウドのレジリエンスとスケーラビリティ、モデル再現性とリソース管理を提供するKubernetesベースのワークフローシステム、フルテキストレポートから構造化診断を抽出するシステムを活用しています。
モデル監視と可視化のプラットフォームについても述べています。
最後に、ターンアラウンド時間に対する影響のデプロイ後分析を行い、生産精度を元の検証統計と比較する。
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