論文の概要: 2D-3D Deformable Image Registration of Histology Slide and Micro-CT with ML-based Initialization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.14343v1
- Date: Fri, 18 Oct 2024 09:51:43 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-21 14:24:24.510315
- Title: 2D-3D Deformable Image Registration of Histology Slide and Micro-CT with ML-based Initialization
- Title(参考訳): 2D-3Dデフォルマブル画像のML初期化による組織スライドとマイクロCTの登録
- Authors: Junan Chen, Matteo Ronchetti, Verena Stehl, Van Nguyen, Muhannad Al Kallaa, Mahesh Thalwaththe Gedara, Claudia Lölkes, Stefan Moser, Maximilian Seidl, Matthias Wieczorek,
- Abstract要約: 軟部組織CTの画質は低かったため,組織スライドとmuCTとの相関が困難であった。
本稿では,新しい2D-3Dマルチモーダルデフォルマブル画像登録法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.1409936129568377
- License:
- Abstract: Recent developments in the registration of histology and micro-computed tomography ({\mu}CT) have broadened the perspective of pathological applications such as virtual histology based on {\mu}CT. This topic remains challenging because of the low image quality of soft tissue CT. Additionally, soft tissue samples usually deform during the histology slide preparation, making it difficult to correlate the structures between histology slide and {\mu}CT. In this work, we propose a novel 2D-3D multi-modal deformable image registration method. The method uses a machine learning (ML) based initialization followed by the registration. The registration is finalized by an analytical out-of-plane deformation refinement. The method is evaluated on datasets acquired from tonsil and tumor tissues. {\mu}CTs of both phase-contrast and conventional absorption modalities are investigated. The registration results from the proposed method are compared with those from intensity- and keypoint-based methods. The comparison is conducted using both visual and fiducial-based evaluations. The proposed method demonstrates superior performance compared to the other two methods.
- Abstract(参考訳): 病理組織学および微小CT({\mu}CT)の登録の最近の進歩は、仮想組織学などの病理学的な応用の視点を広げている。
軟部組織CTの画質が低いため,この話題はいまだに困難である。
また, 軟組織試料は組織学的スライディングの過程で変形し, 組織学的スライディングと組織CTとの相関が困難である。
本研究では,新しい2D-3Dマルチモーダルデフォルマブル画像登録法を提案する。
この方法は機械学習(ML)に基づいて初期化を行い、その後登録する。
登録は、解析的な外面変形改質によって確定される。
本手法は扁桃および腫瘍組織から得られたデータセットを用いて評価する。
位相コントラストと従来の吸収モードの両方のCTについて検討した。
提案手法の登録結果は,強度法とキーポイント法とを比較した。
この比較は視覚的評価と画像的評価の両方を用いて行われる。
提案手法は,他の2手法と比較して優れた性能を示す。
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