論文の概要: Self-supervised Representation Learning for Cell Event Recognition through Time Arrow Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.03924v1
- Date: Wed, 06 Nov 2024 13:54:26 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-07 19:23:22.825791
- Title: Self-supervised Representation Learning for Cell Event Recognition through Time Arrow Prediction
- Title(参考訳): 時間軸予測によるセルイベント認識のための自己教師付き表現学習
- Authors: Cangxiong Chen, Vinay P. Namboodiri, Julia E. Sero,
- Abstract要約: ディープラーニングやセグメンテーショントラッキングの手法は、効果的に動作するための大量の高品質なアノテーションに依存している。
本研究では,セルイベント認識の下流タスクに自己教師付き表現学習(SSRL)の機能アノテーションを用いる方法を提案する。
また,生細胞顕微鏡におけるTAPを用いたSSRLの応用について考察した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 23.611375087515963
- License:
- Abstract: The spatio-temporal nature of live-cell microscopy data poses challenges in the analysis of cell states which is fundamental in bioimaging. Deep-learning based segmentation or tracking methods rely on large amount of high quality annotations to work effectively. In this work, we explore an alternative solution: using feature maps obtained from self-supervised representation learning (SSRL) on time arrow prediction (TAP) for the downstream supervised task of cell event recognition. We demonstrate through extensive experiments and analysis that this approach can achieve better performance with limited annotation compared to models trained from end to end using fully supervised approach. Our analysis also provides insight into applications of the SSRL using TAP in live-cell microscopy.
- Abstract(参考訳): 生細胞顕微鏡データの時空間的性質は、生体イメージングの基本となる細胞状態の解析において課題を提起する。
ディープラーニングに基づくセグメンテーションやトラッキング手法は、効果的に動作するための大量の高品質なアノテーションに依存している。
本研究では,セルイベント認識の下流教師付きタスクに,自己教師付き表現学習(SSRL)から得られた特徴マップを時間矢印予測(TAP)に利用することを提案する。
提案手法は, 完全教師付きアプローチを用いて, 終末から終末まで訓練したモデルと比較して, 限定的なアノテーションで, より優れた性能を実現することができることを示す。
また,生細胞顕微鏡におけるTAPを用いたSSRLの応用について考察した。
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