論文の概要: Are nuclear masks all you need for improved out-of-domain generalisation? A closer look at cancer classification in histopathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.09373v1
- Date: Thu, 14 Nov 2024 11:27:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-15 15:22:41.629289
- Title: Are nuclear masks all you need for improved out-of-domain generalisation? A closer look at cancer classification in histopathology
- Title(参考訳): 核マスクはドメイン外一般化の改善に必要なものなのか?病理組織学におけるがんの分類について
- Authors: Dhananjay Tomar, Alexander Binder, Andreas Kleppe,
- Abstract要約: 我々は,核形態学と組織に着目して,癌検出のためのOODの一般化を改善するための簡単なアプローチを提案する。
本手法では,核分割マスクを原画像と統合し,核の優先順位付けを奨励する。
複数のデータセットを用いて,OODの一般化が向上し,画像の破損や敵攻撃に対するロバスト性も向上することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 49.518701946822446
- License:
- Abstract: Domain generalisation in computational histopathology is challenging because the images are substantially affected by differences among hospitals due to factors like fixation and staining of tissue and imaging equipment. We hypothesise that focusing on nuclei can improve the out-of-domain (OOD) generalisation in cancer detection. We propose a simple approach to improve OOD generalisation for cancer detection by focusing on nuclear morphology and organisation, as these are domain-invariant features critical in cancer detection. Our approach integrates original images with nuclear segmentation masks during training, encouraging the model to prioritise nuclei and their spatial arrangement. Going beyond mere data augmentation, we introduce a regularisation technique that aligns the representations of masks and original images. We show, using multiple datasets, that our method improves OOD generalisation and also leads to increased robustness to image corruptions and adversarial attacks. The source code is available at https://github.com/undercutspiky/SFL/
- Abstract(参考訳): 組織や画像装置の固定や染色などの要因により、画像が病院間の違いによって大きく影響を受けるため、計算病理学における領域の一般化は困難である。
我々は、がん検出において、核に焦点をあてることにより、OPD(out-of- domain)の一般化を改善することができると仮定する。
我々は,がん検出において重要なドメイン不変の特徴である核形態や組織に着目して,癌検出のためのOODの一般化を改善するための簡単なアプローチを提案する。
本手法は,核分割マスクと原画像を統合し,核の優先順位と空間配置をモデルに推奨する。
単にデータ拡張を超えて、マスクとオリジナル画像の表現を整列する正規化手法を導入する。
複数のデータセットを用いて,OODの一般化が向上し,画像の破損や敵攻撃に対するロバスト性も向上することを示す。
ソースコードはhttps://github.com/undercutspiky/SFL/で入手できる。
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