論文の概要: Machine learning approaches to explore important features behind bird flight modes
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2411.09714v1
- Date: Wed, 13 Nov 2024 14:49:51 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-11-18 15:37:15.911479
- Title: Machine learning approaches to explore important features behind bird flight modes
- Title(参考訳): 鳥の飛行モードの背後にある重要な特徴を探索する機械学習アプローチ
- Authors: Yukino Kawai, Tatsuya Hisada, Kozue Shiomi, Momoko Hayamizu,
- Abstract要約: 特徴重要度とSHAP値を用いて,各特徴の相対的重要性を定量化し,重み付きL1距離行列とNJ木の構築に利用した。
本結果は, 相関表現型特徴から生物学的に有用な距離行列を構築することの複雑さを強調した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License:
- Abstract: Birds exhibit a variety of flight styles, primarily classified as flapping, which is characterized by rapid up-and-down wing movements, and soaring, which involves gliding with wings outstretched. Each species usually performs specific flight styles, and this has been argued in terms of morphological and physiological adaptation. However, it remains a challenge to evaluate the contribution of each factor to the difference in flight styles. In this study, using phenotypic data from 635 migratory bird species, such as body mass, wing length, and breeding periods, we quantified the relative importance of each feature using Feature Importance and SHAP values, and used them to construct weighted L1 distance matrices and construct NJ trees. Comparison with traditional phylogenetic logistic regression revealed similarity in top-ranked features, but also differences in overall weight distributions and clustering patterns in NJ trees. Our results highlight the complexity of constructing a biologically useful distance matrix from correlated phenotypic features, while the complementary nature of these weighting methods suggests the potential utility of multi-faceted approaches to assessing feature contributions.
- Abstract(参考訳): 鳥は様々な飛行スタイルを示しており、主に羽ばたきに分類され、急激な上下翼の動きと、羽を広げて滑空する舞踏が特徴である。
通常、各種は特定の飛行様式を採り入れており、形態学的および生理的適応の観点から議論されている。
しかし、飛行スタイルの違いに対する各要因の貢献を評価することは依然として課題である。
本研究では, 体重, 翼長, 繁殖期間などの635種の渡り鳥の表現型データを用いて, 特徴重要度とSHAP値を用いて各特徴の相対的重要性を定量化し, 重み付きL1距離行列の構築とNJ木の構築に利用した。
従来の系統的ロジスティック回帰と比較すると,優占な特徴に類似性が認められたが,NJ木では全体の重み分布とクラスタリングパターンの相違がみられた。
これらの重み付け手法の相補的性質は, 特徴量評価における多面的アプローチの有用性を示唆するものである。
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