論文の概要: Enhanced Lung Cancer Survival Prediction using Semi-Supervised Pseudo-Labeling and Learning from Diverse PET/CT Datasets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2412.00068v1
- Date: Mon, 25 Nov 2024 23:58:37 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-08 08:17:53.236309
- Title: Enhanced Lung Cancer Survival Prediction using Semi-Supervised Pseudo-Labeling and Learning from Diverse PET/CT Datasets
- Title(参考訳): 半監督擬似ラベルを用いた肺がん生存予測と各種PET/CTデータからの学習
- Authors: Mohammad R. Salmanpour, Arman Gorji, Amin Mousavi, Ali Fathi Jouzdani, Nima Sanati, Mehdi Maghsudi, Bonnie Leung, Cheryl Ho, Ren Yuan, Arman Rahmim,
- Abstract要約: ハイブリッド機械学習システム(HMLS)を用いたPET/CTスキャンから手技・深部放射線特性(HRF/DRF)を解析した。
We extract 215 HRFs and 1024 DRFs by PySERA and a 3D-Autoencoder, in the ViSERA software。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.2391222000274618
- License:
- Abstract: Objective: This study explores a semi-supervised learning (SSL), pseudo-labeled strategy using diverse datasets to enhance lung cancer (LCa) survival predictions, analyzing Handcrafted and Deep Radiomic Features (HRF/DRF) from PET/CT scans with Hybrid Machine Learning Systems (HMLS). Methods: We collected 199 LCa patients with both PET & CT images, obtained from The Cancer Imaging Archive (TCIA) and our local database, alongside 408 head&neck cancer (HNCa) PET/CT images from TCIA. We extracted 215 HRFs and 1024 DRFs by PySERA and a 3D-Autoencoder, respectively, within the ViSERA software, from segmented primary tumors. The supervised strategy (SL) employed a HMLSs: PCA connected with 4 classifiers on both HRF and DRFs. SSL strategy expanded the datasets by adding 408 pseudo-labeled HNCa cases (labeled by Random Forest algorithm) to 199 LCa cases, using the same HMLSs techniques. Furthermore, Principal Component Analysis (PCA) linked with 4 survival prediction algorithms were utilized in survival hazard ratio analysis. Results: SSL strategy outperformed SL method (p-value<0.05), achieving an average accuracy of 0.85 with DRFs from PET and PCA+ Multi-Layer Perceptron (MLP), compared to 0.65 for SL strategy using DRFs from CT and PCA+ K-Nearest Neighbor (KNN). Additionally, PCA linked with Component-wise Gradient Boosting Survival Analysis on both HRFs and DRFs, as extracted from CT, had an average c-index of 0.80 with a Log Rank p-value<<0.001, confirmed by external testing. Conclusions: Shifting from HRFs and SL to DRFs and SSL strategies, particularly in contexts with limited data points, enabling CT or PET alone to significantly achieve high predictive performance.
- Abstract(参考訳): 目的:本研究では,種々のデータセットを用いた半教師付き学習(SSL)による肺がん生存予測の強化と,PET/CTスキャンからHMLS(Hybrid Machine Learning Systems)を用いて手技・深部放射線特徴(HRF/DRF)の分析を行う。
方法: 癌画像アーカイブ(TCIA)とローカルデータベースから得られたPET/CT画像とPET/CT画像と,408頭頸部癌(HNCa)PET/CT画像とを併用した199LCaの症例を検索した。
PySERAと3D-Autoencoderで215個のRFと1024個のRFを抽出した。
管理戦略(SL)ではHMLSが採用され、PCAはHRFとDRFの両方で4つの分類器に接続された。
SSL戦略は、同じHMLSs技術を使用して、408の擬似ラベル付きHNCaケース(ランダムフォレストアルゴリズムによってラベル付けされた)を199のLCaケースに追加することでデータセットを拡張した。
さらに,4つの生存予測アルゴリズムに関連付けられた主成分分析(PCA)を生存危険度分析に利用した。
結果: SSL 戦略は SL 法 (p-value<0.05), PET と PCA+ の DRF の平均精度は 0.85 であり, MLP は CT と PCA+ K-Nearest Neighbor (KNN) の DRF を用いた SL 戦略では 0.65 である。
さらに、CTから抽出したHRFとDRFのコンポーネントワイドブースティングサバイバル分析にリンクしたPCAは、平均c-indexが0.80で、ログランクp-value<0.001で、外部試験により確認された。
結論: HRF と SL から DRF へのシフト、SSL 戦略、特に限られたデータポイントを持つコンテキストにおいて、CT や PET だけで高い予測性能を実現できる。
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