論文の概要: rmlnomogram: An R package to construct an explainable nomogram for any machine learning algorithms
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2501.05772v1
- Date: Fri, 10 Jan 2025 08:07:14 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-01-13 15:28:24.072094
- Title: rmlnomogram: An R package to construct an explainable nomogram for any machine learning algorithms
- Title(参考訳): rmlnomogram:任意の機械学習アルゴリズムのための説明可能なノモグラムを構築するためのRパッケージ
- Authors: Herdiantri Sufriyana, Emily Chia-Yu Su,
- Abstract要約: 現在のノモグラムは回帰アルゴリズムのためにのみ作成できる。
我々は、任意の機械学習アルゴリズムのモデル説明可能性でノモグラムを構築するためのRパッケージとWebアプリケーションを開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License:
- Abstract: Background: Current nomogram can only be created for regression algorithm. Providing nomogram for any machine learning (ML) algorithms may accelerate model deployment in clinical settings or improve model availability. We developed an R package and web application to construct nomogram with model explainability of any ML algorithms. Methods: We formulated a function to transform an ML prediction model into a nomogram, requiring datasets with: (1) all possible combinations of predictor values; (2) the corresponding outputs of the model; and (3) the corresponding explainability values for each predictor (optional). Web application was also created. Results: Our R package could create 5 types of nomograms for categorical predictors and binary outcome without probability (1), categorical predictors and binary outcome with probability (2) or continuous outcome (3), and categorical with single numerical predictors and binary outcome with probability (4) or continuous outcome (5). Respectively, the first and remaining types optimally allowed maximum 15 and 5 predictors with maximum 3,200 combinations. Web application is provided with such limits. The explainability values were possible for types 2 to 5. Conclusions: Our R package and web application could construct nomogram with model explainability of any ML algorithms using a fair number of predictors.
- Abstract(参考訳): 背景: 現在のノモグラムは回帰アルゴリズムのためにのみ作成できる。
機械学習(ML)アルゴリズムのノモグラムを提供することで、臨床環境におけるモデルの展開を加速したり、モデルの可用性を向上させることができる。
我々は,任意のMLアルゴリズムのモデル説明可能性を持つノモグラムを構築するためのRパッケージとWebアプリケーションを開発した。
方法: ML予測モデルをノモグラムに変換する関数を定式化し,(1)予測値のすべての組み合わせ,(2)モデルの対応する出力,(3)予測値(オプション)の対応する説明可能性を求める。
Webアプリケーションも作成された。
結果: 我々のRパッケージは, 分類的予測値と2次結果に対して, 確率を伴わない5種類のノモグラム, カテゴリー的予測値, 確率を伴わない2次結果, 確率を伴わない2次結果, 数値的予測値, 確率を伴わない2次結果, 確率を伴わない2次結果の5種類のノモグラムを作成することができる。
比較すると、最初の型と残りの型は最大で15と5の予測器を最大で3,200の組み合わせで許容した。
Webアプリケーションにはそのような制限がある。
説明可能性値はタイプ2から5では可能であった。
結論: 我々のRパッケージとWebアプリケーションは,任意のMLアルゴリズムのモデル説明可能性を備えたノモグラムを,かなりの数の予測器を用いて構築することができる。
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