論文の概要: StarMAP: Global Neighbor Embedding for Faithful Data Visualization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2502.03776v1
- Date: Thu, 06 Feb 2025 04:43:07 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-02-07 14:32:06.274623
- Title: StarMAP: Global Neighbor Embedding for Faithful Data Visualization
- Title(参考訳): StarMAP: 忠実なデータ可視化のためのグローバルな隣人埋め込み
- Authors: Koshi Watanabe, Keisuke Maeda, Takahiro Ogawa, Miki Haseyama,
- Abstract要約: 隣の埋め込みはしばしばグローバル構造、例えばクラスタ間類似性を見落とし、正確な視覚化を妨げる。
本稿では,隣接する埋め込みにおける主成分分析(PCA)の利点を取り入れたStarMAP(Star-attracted Manifold Approximation and Projection)を提案する。
StarMAPは、隣接する埋め込みの解釈可能性と計算効率を維持しながら、忠実なグローバル構造を保存する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 41.13597666007784
- License:
- Abstract: Neighbor embedding is widely employed to visualize high-dimensional data; however, it frequently overlooks the global structure, e.g., intercluster similarities, thereby impeding accurate visualization. To address this problem, this paper presents Star-attracted Manifold Approximation and Projection (StarMAP), which incorporates the advantage of principal component analysis (PCA) in neighbor embedding. Inspired by the property of PCA embedding, which can be viewed as the largest shadow of the data, StarMAP introduces the concept of \textit{star attraction} by leveraging the PCA embedding. This approach yields faithful global structure preservation while maintaining the interpretability and computational efficiency of neighbor embedding. StarMAP was compared with existing methods in the visualization tasks of toy datasets, single-cell RNA sequencing data, and deep representation. The experimental results show that StarMAP is simple but effective in realizing faithful visualizations.
- Abstract(参考訳): 近隣の埋め込みは高次元データの可視化に広く用いられているが、グローバルな構造、例えばクラスタ間類似性を見落とし、正確な可視化を妨げていることが多い。
そこで本研究では,隣接する埋め込みにおける主成分分析(PCA)の利点を活かした,StarMAP(Star-attracted Manifold Approximation and Projection)を提案する。
データの最大の影と見なせるPCA埋め込みの特性にインスパイアされたStarMAPは、PCA埋め込みを活用することによって、‘textit{star attract}’という概念を導入した。
このアプローチは、隣接する埋め込みの解釈可能性と計算効率を維持しながら、忠実なグローバルな構造保存をもたらす。
StarMAPは、おもちゃのデータセット、シングルセルRNAシークエンシングデータ、深層表現の可視化タスクにおける既存の手法と比較された。
実験の結果,StarMAPは単純だが忠実な可視化を実現するのに有効であることがわかった。
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