論文の概要: 4D VQ-GAN: Synthesising Medical Scans at Any Time Point for Personalised Disease Progression Modelling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2502.05713v1
- Date: Sat, 08 Feb 2025 22:25:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-02-11 14:35:59.239201
- Title: 4D VQ-GAN: Synthesising Medical Scans at Any Time Point for Personalised Disease Progression Modelling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
- Title(参考訳): 4D VQ-GAN : 特発性肺線維症のパーソナライズド疾患進行モデルのための医療スキャンの任意の時点における合成
- Authors: An Zhao, Moucheng Xu, Ahmed H. Shahin, Wim Wuyts, Mark G. Jones, Joseph Jacob, Daniel C. Alexander,
- Abstract要約: 我々は,IPF患者をリアルなCTボリュームで生成できるモデルである4D-VQ-GAN(4D Vector Quantated Generative Adversarial Networks)を提案する。
縦断的CT画像を生成するためのモデルの異なる構成を評価し, 結果と地中真理データを比較した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.926086195644801
- License:
- Abstract: Understanding the progression trajectories of diseases is crucial for early diagnosis and effective treatment planning. This is especially vital for life-threatening conditions such as Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF), a chronic, progressive lung disease with a prognosis comparable to many cancers. Computed tomography (CT) imaging has been established as a reliable diagnostic tool for IPF. Accurately predicting future CT scans of early-stage IPF patients can aid in developing better treatment strategies, thereby improving survival outcomes. In this paper, we propose 4D Vector Quantised Generative Adversarial Networks (4D-VQ-GAN), a model capable of generating realistic CT volumes of IPF patients at any time point. The model is trained using a two-stage approach. In the first stage, a 3D-VQ-GAN is trained to reconstruct CT volumes. In the second stage, a Neural Ordinary Differential Equation (ODE) based temporal model is trained to capture the temporal dynamics of the quantised embeddings generated by the encoder in the first stage. We evaluate different configurations of our model for generating longitudinal CT scans and compare the results against ground truth data, both quantitatively and qualitatively. For validation, we conduct survival analysis using imaging biomarkers derived from generated CT scans and achieve a C-index comparable to that of biomarkers derived from the real CT scans. The survival analysis results demonstrate the potential clinical utility inherent to generated longitudinal CT scans, showing that they can reliably predict survival outcomes.
- Abstract(参考訳): 疾患の進行軌跡を理解することは早期診断と効果的な治療計画に不可欠である。
特発性肺線維症(IPF)は慢性進行性肺疾患であり、多くのがんに匹敵する予後を示す。
IPFの診断ツールとしてCTが確立されている。
早期IPF患者のCTスキャンの正確な予測は、より良い治療戦略の開発に役立ち、生存率を改善する。
本稿では,IPF患者のリアルタイムCTボリュームを任意の時点から生成できるモデルである4D-VQ-GAN(4D Vector Quantated Generative Adversarial Networks)を提案する。
このモデルは2段階のアプローチで訓練されている。
第1段階では、3D-VQ-GANをトレーニングしてCTボリュームを再構築する。
第2段階では、ニューラル正規微分方程式(ODE)に基づく時間モデルを訓練し、エンコーダが生成した量子化埋め込みの時間的ダイナミクスを第1段階で捉える。
我々は,縦断的CTスキャンを作成するためのモデルの異なる構成を評価し,その結果と地上の真実データを定量的に,質的に比較した。
そこで本研究では,CTスキャンから得られた画像バイオマーカーを用いて生存分析を行い,実際のCTスキャンから得られたバイオマーカーに匹敵するCインデクスを実現する。
生存分析の結果, 経時的CTスキャンに固有の臨床的有用性を示し, 生存率を確実に予測できることが示唆された。
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