論文の概要: The Case for Cleaner Biosignals: High-fidelity Neural Compressor Enables Transfer from Cleaner iEEG to Noisier EEG
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2502.17462v1
- Date: Mon, 10 Feb 2025 15:05:06 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-02 03:22:57.831715
- Title: The Case for Cleaner Biosignals: High-fidelity Neural Compressor Enables Transfer from Cleaner iEEG to Noisier EEG
- Title(参考訳): よりクリーンな生体信号:高忠実なニューラル圧縮機は、よりクリーンなiEEGからよりノイズの多い脳波への移行を可能にする
- Authors: Francesco Stefano Carzaniga, Gary Tom Hoppeler, Michael Hersche, Kaspar Anton Schindler, Abbas Rahimi,
- Abstract要約: 我々は高忠実度脳波とiEEGニューラル圧縮器であるBrainCodecを提案する。
iEEGでBrainCodecをトレーニングし、EEGに移行すると、EEGで直接トレーニングするよりも高い再現品質が得られることがわかりました。
BrainCodecは、最終的な圧縮比と再構築忠実度の両方において、最先端の圧縮モデルを大幅に上回っている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.067854443947429
- License:
- Abstract: All data modalities are not created equal, even when the signal they measure comes from the same source. In the case of the brain, two of the most important data modalities are the scalp electroencephalogram (EEG), and the intracranial electroencephalogram (iEEG). They are used by human experts, supported by deep learning (DL) models, to accomplish a variety of tasks, such as seizure detection and motor imagery classification. Although the differences between EEG and iEEG are well understood by human experts, the performance of DL models across these two modalities remains under-explored. To help characterize the importance of clean data on the performance of DL models, we propose BrainCodec, a high-fidelity EEG and iEEG neural compressor. We find that training BrainCodec on iEEG and then transferring to EEG yields higher reconstruction quality than training on EEG directly. In addition, we also find that training BrainCodec on both EEG and iEEG improves fidelity when reconstructing EEG. Our work indicates that data sources with higher SNR, such as iEEG, provide better performance across the board also in the medical time-series domain. BrainCodec also achieves up to a 64x compression on iEEG and EEG without a notable decrease in quality. BrainCodec markedly surpasses current state-of-the-art compression models both in final compression ratio and in reconstruction fidelity. We also evaluate the fidelity of the compressed signals objectively on a seizure detection and a motor imagery task performed by standard DL models. Here, we find that BrainCodec achieves a reconstruction fidelity high enough to ensure no performance degradation on the downstream tasks. Finally, we collect the subjective assessment of an expert neurologist, that confirms the high reconstruction quality of BrainCodec in a realistic scenario. The code is available at https://github.com/IBM/eeg-ieeg-brain-compressor.
- Abstract(参考訳): すべてのデータモダリティは、測定した信号が同じソースから来ている場合でも、等しく作成されない。
脳の場合、最も重要なデータモダリティは頭皮脳波(EEG)と頭蓋内脳波(iEEG)である。
これらは、深層学習(DL)モデルによって支援された人間の専門家によって、発作検出や運動画像分類などの様々なタスクを達成するために使用される。
脳波とiEEGの違いは人間の専門家によってよく理解されているが、これらの2つのモードにわたるDLモデルの性能は未解明のままである。
DLモデルの性能に対するクリーンなデータの重要性を特徴付けるために,高忠実度脳波とiEEGニューラル圧縮機であるBrainCodecを提案する。
iEEGでBrainCodecをトレーニングし、EEGに移行すると、EEGで直接トレーニングするよりも高い再現品質が得られることがわかりました。
また、脳波とiEEGの両方でBrainCodecのトレーニングを行うことで、脳波の再構築時の忠実度が向上することがわかった。
本研究は,iEEGなどのSNRの高いデータソースが,医用タイムシリーズドメインにおいても,ボード全体のパフォーマンスを向上させることを示唆している。
BrainCodecはまた、特筆すべき品質低下なしに、iEEGとEEGの最大64倍の圧縮を実現している。
BrainCodecは、最終的な圧縮比と再構築忠実度の両方において、最先端の圧縮モデルを大きく上回っている。
また、圧縮された信号の忠実度を、標準DLモデルによる発作検出と運動画像タスクに基づいて客観的に評価する。
ここでは、BrainCodecは、下流タスクのパフォーマンス劣化を確実に抑えるのに十分な再現性を達成する。
最後に,BrainCodecの再現性の高さを現実的なシナリオで確認する,専門神経学者の主観的評価を収集する。
コードはhttps://github.com/IBM/eeg-ieeg-brain-compressorで公開されている。
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