論文の概要: Disconnect to Connect: A Data Augmentation Method for Improving Topology Accuracy in Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.05541v1
- Date: Fri, 07 Mar 2025 16:11:55 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-10 15:56:34.770541
- Title: Disconnect to Connect: A Data Augmentation Method for Improving Topology Accuracy in Image Segmentation
- Title(参考訳): Disconnect to Connect:画像セグメンテーションにおけるトポロジ精度向上のためのデータ拡張手法
- Authors: Juan Miguel Valverde, Maja Østergaard, Adrian Rodriguez-Palomo, Peter Alling Strange Vibe, Nina Kølln Wittig, Henrik Birkedal, Anders Bjorholm Dahl,
- Abstract要約: ディープニューラルネットワークは個々のピクセルを分類し、小さな誤分類でさえ、これらの構造内の細い接続を壊す可能性がある。
トポロジ損失関数のような既存のトポロジ精度向上手法は、非常に正確で、トポロジ的に正確なトレーニングラベルに依存している。
我々は、データ拡張戦略であるCoLeTraを紹介します。これは、壊れているように見える構造が実際に接続されているという以前の知識をモデルに統合するものです。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.493599216374976
- License:
- Abstract: Accurate segmentation of thin, tubular structures (e.g., blood vessels) is challenging for deep neural networks. These networks classify individual pixels, and even minor misclassifications can break the thin connections within these structures. Existing methods for improving topology accuracy, such as topology loss functions, rely on very precise, topologically-accurate training labels, which are difficult to obtain. This is because annotating images, especially 3D images, is extremely laborious and time-consuming. Low image resolution and contrast further complicates the annotation by causing tubular structures to appear disconnected. We present CoLeTra, a data augmentation strategy that integrates to the models the prior knowledge that structures that appear broken are actually connected. This is achieved by creating images with the appearance of disconnected structures while maintaining the original labels. Our extensive experiments, involving different architectures, loss functions, and datasets, demonstrate that CoLeTra leads to segmentations topologically more accurate while often improving the Dice coefficient and Hausdorff distance. CoLeTra's hyper-parameters are intuitive to tune, and our sensitivity analysis shows that CoLeTra is robust to changes in these hyper-parameters. We also release a dataset specifically suited for image segmentation methods with a focus on topology accuracy. CoLetra's code can be found at https://github.com/jmlipman/CoLeTra.
- Abstract(参考訳): 深層ニューラルネットワークでは,細管構造(血管など)の正確なセグメンテーションが困難である。
これらのネットワークは個々のピクセルを分類し、小さな誤分類でさえこれらの構造内の細い接続を壊す可能性がある。
トポロジ損失関数のような既存のトポロジ精度向上手法は、非常に正確で、トポロジ的に正確なトレーニングラベルに依存しており、入手が困難である。
これは、注釈付き画像、特に3D画像は、非常に退屈で時間を要するためです。
低解像度とコントラストは、管状構造が切断されたように見えることによってアノテーションをさらに複雑にする。
我々は、データ拡張戦略であるCoLeTraを紹介します。これは、壊れているように見える構造が実際に接続されているという以前の知識をモデルに統合するものです。
これは、元のラベルを維持しながら、切断された構造の外観で画像を作成することで達成される。
異なるアーキテクチャ、損失関数、データセットを含む我々の広範な実験は、CoLeTraが、Dice係数とハウスドルフ距離をよく改善しながら、位相的により正確なセグメンテーションをもたらすことを示した。
CoLeTraのハイパーパラメータは直感的にチューニングでき、感度解析により、CoLeTraはこれらのハイパーパラメータの変化に対して堅牢であることが示された。
また、トポロジの精度を重視した画像分割法に適したデータセットもリリースした。
CoLetraのコードはhttps://github.com/jmlipman/CoLeTraにある。
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