論文の概要: CountPath: Automating Fragment Counting in Digital Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.10520v1
- Date: Thu, 13 Mar 2025 16:29:16 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-14 15:55:10.519249
- Title: CountPath: Automating Fragment Counting in Digital Pathology
- Title(参考訳): CountPath: デジタル病理におけるフラグメント数の自動管理
- Authors: Ana Beatriz Vieira, Maria Valente, Diana Montezuma, Tomé Albuquerque, Liliana Ribeiro, Domingos Oliveira, João Monteiro, Sofia Gonçalves, Isabel M. Pinto, Jaime S. Cardoso, Arlindo L. Oliveira,
- Abstract要約: 本研究では, YOLOv9モデルとVision Transformerモデルを用いたフラグメントカウントの自動手法について検討する。
この結果から,自動システムは専門家による評価に匹敵する性能を達成し,手動計数に代わる信頼性と効率的な代替手段を提供することを示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.942240623236146
- License:
- Abstract: Quality control of medical images is a critical component of digital pathology, ensuring that diagnostic images meet required standards. A pre-analytical task within this process is the verification of the number of specimen fragments, a process that ensures that the number of fragments on a slide matches the number documented in the macroscopic report. This step is important to ensure that the slides contain the appropriate diagnostic material from the grossing process, thereby guaranteeing the accuracy of subsequent microscopic examination and diagnosis. Traditionally, this assessment is performed manually, requiring significant time and effort while being subject to significant variability due to its subjective nature. To address these challenges, this study explores an automated approach to fragment counting using the YOLOv9 and Vision Transformer models. Our results demonstrate that the automated system achieves a level of performance comparable to expert assessments, offering a reliable and efficient alternative to manual counting. Additionally, we present findings on interobserver variability, showing that the automated approach achieves an accuracy of 86%, which falls within the range of variation observed among experts (82-88%), further supporting its potential for integration into routine pathology workflows.
- Abstract(参考訳): 医療画像の品質管理はデジタル病理学の重要な要素であり、診断画像が要求される基準を満たすことを保証する。
このプロセスにおける事前分析のタスクは、標本の断片の数を検証することであり、スライド上の断片の数がマクロ的なレポートに記録された数と一致することを確実にするプロセスである。
この工程は、グルーニング工程から適切な診断材料を含むスライドを確実に含有し、その後の顕微鏡検査および診断の精度を保証することが重要である。
伝統的に、この評価は手作業で行われ、主観的な性質から大きな変動を受けながら、かなりの時間と労力を要する。
これらの課題に対処するため, YOLOv9とVision Transformerモデルを用いたフラグメントカウントの自動手法について検討した。
この結果から,自動システムは専門家による評価に匹敵する性能を達成し,手動計数に代わる信頼性と効率的な代替手段を提供することを示した。
さらに, 自動アプローチが86%の精度を達成し, 専門家の間で観察される変動範囲(82~88%)に収まることを示し, また, 定期的な病理ワークフローへの統合の可能性も裏付ける。
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