論文の概要: VGAT: A Cancer Survival Analysis Framework Transitioning from Generative Visual Question Answering to Genomic Reconstruction

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.19367v2
• Date: Sat, 29 Mar 2025 12:05:53 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-04-01 13:14:21.775271
• Title: VGAT: A Cancer Survival Analysis Framework Transitioning from Generative Visual Question Answering to Genomic Reconstruction
• Title（参考訳）: VGAT: 生成的視覚質問応答からゲノム再構成へ移行したがん生存分析フレームワーク
• Authors: Zizhi Chen, Minghao Han, Xukun Zhang, Shuwei Ma, Tao Liu, Xing Wei, Lihua Zhang,
• Abstract要約: 本稿では,VQA(Visual Question Answering)技術を統合したゲノムモダリティ再構築手法を提案する。 VQAのテキスト特徴抽出手法を適用することで、生ゲノムデータの次元問題を回避する安定なゲノム表現を導出する。 5つのTCGAデータセットで評価され、VGATは既存のWSIのみのメソッドより優れている。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 18.237801653049885
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Multimodal learning combining pathology images and genomic sequences enhances cancer survival analysis but faces clinical implementation barriers due to limited access to genomic sequencing in under-resourced regions. To enable survival prediction using only whole-slide images (WSI), we propose the Visual-Genomic Answering-Guided Transformer (VGAT), a framework integrating Visual Question Answering (VQA) techniques for genomic modality reconstruction. By adapting VQA's text feature extraction approach, we derive stable genomic representations that circumvent dimensionality challenges in raw genomic data. Simultaneously, a cluster-based visual prompt module selectively enhances discriminative WSI patches, addressing noise from unfiltered image regions. Evaluated across five TCGA datasets, VGAT outperforms existing WSI-only methods, demonstrating the viability of genomic-informed inference without sequencing. This approach bridges multimodal research and clinical feasibility in resource-constrained settings. The code link is https://github.com/CZZZZZZZZZZZZZZZZZ/VGAT.
• Abstract（参考訳）: 病理画像とゲノム配列を組み合わせたマルチモーダル学習は、がん生存率分析を促進させるが、アンダーリソース領域におけるゲノムシークエンシングの制限による臨床実装障壁に直面する。 本研究では,全スライディング画像のみを用いた生存予測を実現するために,VGAT (Visual-Genomic Answering-Guided Transformer) を提案する。 VQAのテキスト特徴抽出手法を適用することで、生ゲノムデータの次元問題を回避する安定なゲノム表現を導出する。 同時に、クラスタベースのビジュアルプロンプトモジュールは、フィルタされていない画像領域からのノイズに対処して、差別的なWSIパッチを選択的に強化する。 5つのTCGAデータセットで評価され、VGATは既存のWSIのみの手法より優れている。 このアプローチは、資源制約された環境でのマルチモーダルな研究と臨床実現可能性に橋渡しする。 コードリンクはhttps://github.com/CZZZZZZZZZZZZZZZZZZ/VGAT。

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