論文の概要: Force-Free Molecular Dynamics Through Autoregressive Equivariant Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2503.23794v1
- Date: Mon, 31 Mar 2025 07:14:32 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-01 14:32:33.783707
- Title: Force-Free Molecular Dynamics Through Autoregressive Equivariant Networks
- Title(参考訳): 自己回帰同変ネットワークによる無力分子動力学
- Authors: Fabian L. Thiemann, Thiago Reschützegger, Massimiliano Esposito, Tseden Taddese, Juan D. Olarte-Plata, Fausto Martelli,
- Abstract要約: 我々は、自動回帰メッセージパッシングネットワークに基づく転送可能でデータ効率のよいフレームワークであるTrajCastを紹介した。
われわれのフレームワークは、小さな分子、結晶性物質、バルク液体など、さまざまなシステムにまたがってベンチマークを行っている。
システムによっては、TrajCast は従来の MD のタイムステップよりも最大30倍の間隔で予測でき、4000原子以上の固体に対して1日15 ns以上の軌道データを生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
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- Abstract: Molecular dynamics (MD) simulations play a crucial role in scientific research. Yet their computational cost often limits the timescales and system sizes that can be explored. Most data-driven efforts have been focused on reducing the computational cost of accurate interatomic forces required for solving the equations of motion. Despite their success, however, these machine learning interatomic potentials (MLIPs) are still bound to small time-steps. In this work, we introduce TrajCast, a transferable and data-efficient framework based on autoregressive equivariant message passing networks that directly updates atomic positions and velocities lifting the constraints imposed by traditional numerical integration. We benchmark our framework across various systems, including a small molecule, crystalline material, and bulk liquid, demonstrating excellent agreement with reference MD simulations for structural, dynamical, and energetic properties. Depending on the system, TrajCast allows for forecast intervals up to $30\times$ larger than traditional MD time-steps, generating over 15 ns of trajectory data per day for a solid with more than 4,000 atoms. By enabling efficient large-scale simulations over extended timescales, TrajCast can accelerate materials discovery and explore physical phenomena beyond the reach of traditional simulations and experiments. An open-source implementation of TrajCast is accessible under https://github.com/IBM/trajcast.
- Abstract(参考訳): 分子動力学(MD)シミュレーションは科学研究において重要な役割を果たす。
しかし、その計算コストは、探索可能な時間スケールとシステムサイズを制限することが多い。
データ駆動のほとんどの取り組みは、運動方程式を解くのに必要な正確な原子間力の計算コストの削減に焦点が当てられている。
しかし、それらの成功にもかかわらず、これらの機械学習原子間ポテンシャル(MLIP)は依然として小さな時間ステップに縛られている。
本稿では、原子位置を直接更新し、従来の数値積分による制約を緩和する自動回帰同変メッセージパッシングネットワークに基づく、転送可能でデータ効率のよいフレームワークであるTrajCastを紹介する。
我々は, 分子, 結晶材料, バルク液体など, 様々なシステムにまたがってフレームワークをベンチマークし, 構造, 動的, エネルギー特性に関するMDシミュレーションと良好な一致を示した。
システムによっては、TrajCastは従来のMDタイムステップよりも30\times$の予測間隔を可能にし、4000以上の原子を持つ固体に対して1日15 ns以上の軌道データを生成する。
長期にわたって効率的な大規模なシミュレーションを可能にすることで、TrajCastは材料発見を加速し、従来のシミュレーションや実験の範囲を超えて物理的現象を探索することができる。
TrajCastのオープンソース実装はhttps://github.com/IBM/trajcastで利用できる。
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