論文の概要: nnLandmark: A Self-Configuring Method for 3D Medical Landmark Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.06742v1
- Date: Wed, 09 Apr 2025 09:53:39 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-04-10 13:06:18.684750
- Title: nnLandmark: A Self-Configuring Method for 3D Medical Landmark Detection
- Title(参考訳): nnLandmark:3D医療ランドマーク検出のための自己設定方法
- Authors: Alexandra Ertl, Shuhan Xiao, Stefan Denner, Robin Peretzke, David Zimmerer, Peter Neher, Fabian Isensee, Klaus Maier-Hein,
- Abstract要約: この研究は3D医療ランドマーク検出のための自己構成型ディープラーニングフレームワークであるnnLandmarkを紹介している。
nnLandmarkは手動のパラメータチューニングの必要性を排除し、アウト・オブ・ボックスのユーザビリティを提供する。
下顎臼歯部CTデータセット(MML)に1.5mmの放射平均誤差(MRE)、脳MRIデータセット(AFIDs)に1.2mmの解剖学的画像を含む2つの公的データセットにまたがる最先端の精度を実現する。
nnLandmarkは、3Dランドマーク検出のための信頼性の高いベースラインを確立し、解剖学的局在の研究を支援している
- 参考スコア(独自算出の注目度): 35.41030755599218
- License:
- Abstract: Landmark detection plays a crucial role in medical imaging tasks that rely on precise spatial localization, including specific applications in diagnosis, treatment planning, image registration, and surgical navigation. However, manual annotation is labor-intensive and requires expert knowledge. While deep learning shows promise in automating this task, progress is hindered by limited public datasets, inconsistent benchmarks, and non-standardized baselines, restricting reproducibility, fair comparisons, and model generalizability.This work introduces nnLandmark, a self-configuring deep learning framework for 3D medical landmark detection, adapting nnU-Net to perform heatmap-based regression. By leveraging nnU-Net's automated configuration, nnLandmark eliminates the need for manual parameter tuning, offering out-of-the-box usability. It achieves state-of-the-art accuracy across two public datasets, with a mean radial error (MRE) of 1.5 mm on the Mandibular Molar Landmark (MML) dental CT dataset and 1.2 mm for anatomical fiducials on a brain MRI dataset (AFIDs), where nnLandmark aligns with the inter-rater variability of 1.5 mm. With its strong generalization, reproducibility, and ease of deployment, nnLandmark establishes a reliable baseline for 3D landmark detection, supporting research in anatomical localization and clinical workflows that depend on precise landmark identification. The code will be available soon.
- Abstract(参考訳): ランドマーク検出は、診断、治療計画、画像登録、手術ナビゲーションなど、正確な空間的位置決めに依存する医療画像タスクにおいて重要な役割を担っている。
しかし、マニュアルアノテーションは労働集約的であり、専門家の知識を必要とする。
ディープラーニングは、このタスクを自動化する上で有望であることを示しているが、進歩は、限定された公開データセット、一貫性のないベンチマーク、非標準ベースラインによって妨げられ、再現性、公正な比較、モデルの一般化が制限される。この研究は、nnLandmarkを導入している。nnLandmarkは、3D医療ランドマーク検出のための自己構成型のディープラーニングフレームワークで、nnU-Netをヒートマップベースのレグレッションに適応させる。
nnU-Netの自動設定を活用することで、nnLandmarkは手動パラメータチューニングの必要性を排除し、アウト・オブ・ザ・ボックスのユーザビリティを提供する。
下顎臼歯部CTデータセット(MML)の平均半径誤差(MRE)が1.5mm、脳MRIデータセット(AFID)の解剖学的画像に対して1.2mmであり、nnLandmarkは1.5mm間の変動と一致している。
その強力な一般化、再現性、展開の容易さにより、nnLandmarkは、3Dランドマーク検出のための信頼性の高いベースラインを確立し、解剖学的ローカライゼーションと正確なランドマーク識別に依存する臨床ワークフローの研究を支援している。
コードはまもなく利用可能になる。
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