論文の概要: A Multimodal Deep Learning Approach for White Matter Shape Prediction in Diffusion MRI Tractography
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.18400v1
- Date: Fri, 25 Apr 2025 14:54:47 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-02 19:15:53.803836
- Title: A Multimodal Deep Learning Approach for White Matter Shape Prediction in Diffusion MRI Tractography
- Title(参考訳): 拡散MRIトラクトグラフィにおける白質形状予測のための多モード深層学習手法
- Authors: Yui Lo, Yuqian Chen, Dongnan Liu, Leo Zekelman, Jarrett Rushmore, Yogesh Rathi, Nikos Makris, Alexandra J. Golby, Fan Zhang, Weidong Cai, Lauren J. O'Donnell,
- Abstract要約: そこで我々は,10個の白質トラクトグラフィー形状を予測できる新しいディープラーニングフレームワークであるTract2Shapeを提案する。
モデル効率を向上させるために,モデルの次元削減アルゴリズムを用いて5つの一次形状成分を予測した。
本研究では,HCP-YAデータセットと未確認PPMIデータセットを用いて,Tract2Shapeの性能評価を行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 40.91207723143099
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Shape measures have emerged as promising descriptors of white matter tractography, offering complementary insights into anatomical variability and associations with cognitive and clinical phenotypes. However, conventional methods for computing shape measures are computationally expensive and time-consuming for large-scale datasets due to reliance on voxel-based representations. We propose Tract2Shape, a novel multimodal deep learning framework that leverages geometric (point cloud) and scalar (tabular) features to predict ten white matter tractography shape measures. To enhance model efficiency, we utilize a dimensionality reduction algorithm for the model to predict five primary shape components. The model is trained and evaluated on two independently acquired datasets, the HCP-YA dataset, and the PPMI dataset. We evaluate the performance of Tract2Shape by training and testing it on the HCP-YA dataset and comparing the results with state-of-the-art models. To further assess its robustness and generalization ability, we also test Tract2Shape on the unseen PPMI dataset. Tract2Shape outperforms SOTA deep learning models across all ten shape measures, achieving the highest average Pearson's r and the lowest nMSE on the HCP-YA dataset. The ablation study shows that both multimodal input and PCA contribute to performance gains. On the unseen testing PPMI dataset, Tract2Shape maintains a high Pearson's r and low nMSE, demonstrating strong generalizability in cross-dataset evaluation. Tract2Shape enables fast, accurate, and generalizable prediction of white matter shape measures from tractography data, supporting scalable analysis across datasets. This framework lays a promising foundation for future large-scale white matter shape analysis.
- Abstract(参考訳): 形状測定はホワイトマタートラクトグラフィーの有望な記述として現れ、解剖学的多様性と認知的および臨床的表現型との関連性に関する補完的な洞察を提供する。
しかし、従来の形状測定法は、ボクセルに基づく表現に依存するため、大規模データセットでは計算コストが高く、時間を要する。
幾何学的特徴(点雲)とスカラー特徴(タブラル)を活用して10個の白色物質トラクトグラフィー形状を推定する,新しい多モード深層学習フレームワークであるTract2Shapeを提案する。
モデル効率を向上させるために,モデルの次元削減アルゴリズムを用いて5つの一次形状成分を予測した。
このモデルは、HCP-YAデータセットとPPMIデータセットという、独立に取得した2つのデータセットでトレーニングされ、評価される。
我々は、HCP-YAデータセット上でのトレーニングとテストによりTract2Shapeの性能を評価し、その結果を最先端のモデルと比較した。
さらに、その堅牢性と一般化能力を評価するために、未確認PPMIデータセット上でTract2Shapeをテストする。
Tract2Shapeは、HCP-YAデータセット上で、平均的なピアソンのrと最低のnMSEを達成し、全10の形状測定でSOTAディープラーニングモデルを上回っている。
アブレーション研究では,マルチモーダル入力とPCAの両方が性能向上に寄与していることが示された。
未確認のPPMIデータセットでは、Tract2ShapeはピアソンのrとnMSEを高く維持し、クロスデータセット評価において強い一般化性を示す。
Tract2Shapeは、トラクトグラフィーデータからホワイトマター形状測定の高速、高精度、一般化可能な予測を可能にし、データセット間のスケーラブルな分析をサポートする。
この枠組みは、将来の大規模ホワイトマター形状解析に有望な基盤を築き上げている。
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