論文の概要: Semi-Automated Quality Assurance in Digital Pathology: Tile Classification Approach
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.10916v1
- Date: Thu, 12 Jun 2025 17:30:34 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-13 15:37:22.867252
- Title: Semi-Automated Quality Assurance in Digital Pathology: Tile Classification Approach
- Title(参考訳): デジタル病理における半自動品質保証:タイル分類アプローチ
- Authors: Meredith VandeHaar, M. Clinch, I. Yilmaz, M. A. Rahman, Y. Xiao, F. Dogany, H. M. Alazab, A. Nassar, Z. Akkus, B. Dangott,
- Abstract要約: 品質保証は、デジタル病理学において重要だが未調査の分野である。
人工物はAI診断モデルの性能に悪影響を及ぼすことが示されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Quality assurance is a critical but underexplored area in digital pathology, where even minor artifacts can have significant effects. Artifacts have been shown to negatively impact the performance of AI diagnostic models. In current practice, trained staff manually review digitized images prior to release of these slides to pathologists which are then used to render a diagnosis. Conventional image processing approaches, provide a foundation for detecting artifacts on digital pathology slides. However, current tools do not leverage deep learning, which has the potential to improve detection accuracy and scalability. Despite these advancements, methods for quality assurance in digital pathology remain limited, presenting a gap for innovation. We propose an AI algorithm designed to screen digital pathology slides by analyzing tiles and categorizing them into one of 10 predefined artifact types or as background. This algorithm identifies and localizes artifacts, creating a map that highlights regions of interest. By directing human operators to specific tiles affected by artifacts, the algorithm minimizes the time and effort required to manually review entire slides for quality issues. From internal archives and The Cancer Genome Atlas, 133 whole slide images were selected and 10 artifacts were annotated using an internally developed software ZAPP (Mayo Clinic, Jacksonville, FL). Ablation study of multiple models at different tile sizes and magnification was performed. InceptionResNet was selected. Single artifact models were trained and tested, followed by a limited multiple instance model with artifacts that performed well together (chatter, fold, and pen). From the results of this study we suggest a hybrid design for artifact screening composed of both single artifact binary models as well as multiple instance models to optimize detection of each artifact.
- Abstract(参考訳): 品質保証は、デジタル病理学において重要ではあるが未調査の領域であり、マイナーアーティファクトでさえも重大な影響を及ぼす可能性がある。
人工物はAI診断モデルの性能に悪影響を及ぼすことが示されている。
現在、トレーニングされたスタッフは、これらのスライドがリリースされる前に手動でデジタル化されたイメージを病理医にレビューし、診断を描画するために使用される。
従来の画像処理アプローチは、デジタル病理スライド上のアーティファクトを検出するための基盤を提供する。
しかし、現在のツールはディープラーニングを活用せず、検出精度とスケーラビリティを向上させる可能性がある。
これらの進歩にもかかわらず、デジタル病理学における品質保証の方法はまだ限られており、イノベーションのギャップを生じさせている。
タイルを分析し,それを10種類の事前定義されたアーティファクトタイプ,あるいは背景として分類することで,デジタル病理スライドをスクリーニングするAIアルゴリズムを提案する。
このアルゴリズムは、アーティファクトを特定し、ローカライズし、関心のある領域をハイライトするマップを作成する。
人工物によって影響を受ける特定のタイルに人間のオペレーターを誘導することにより、アルゴリズムは、品質問題に対して手動でスライド全体をレビューするために必要な時間と労力を最小化する。
内部アーカイブとThe Cancer Genome Atlasから133枚のスライド画像が選択され、10枚のアーティファクトが社内開発ソフトウェアZAPP(メイヨークリニック、ジャクソンビル、FL)を使って注釈付けされた。
異なるタイルサイズおよび倍率の複数のモデルのアブレーション実験を行った。
InceptionResNetが選択された。
単一のアーティファクトモデルがトレーニングされ、テストされ、続いて、一緒に動作するアーティファクト(シャッター、折りたたみ、ペン)を備えた、限定された複数のインスタンスモデルが続いた。
本研究の結果から,1つのアーティファクトバイナリモデルと,各アーティファクトの検出を最適化する複数のインスタンスモデルからなるアーティファクトスクリーニングのハイブリッド設計を提案する。
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