論文の概要: ZeroReg3D: A Zero-shot Registration Pipeline for 3D Consecutive Histopathology Image Reconstruction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.21923v1
- Date: Fri, 27 Jun 2025 05:31:23 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-30 21:12:23.098352
- Title: ZeroReg3D: A Zero-shot Registration Pipeline for 3D Consecutive Histopathology Image Reconstruction
- Title(参考訳): ZeroReg3D:3D画像再構成のためのゼロショットレジストレーションパイプライン
- Authors: Juming Xiong, Ruining Deng, Jialin Yue, Siqi Lu, Junlin Guo, Marilyn Lionts, Tianyuan Yao, Can Cui, Junchao Zhu, Chongyu Qu, Mengmeng Yin, Haichun Yang, Yuankai Huo,
- Abstract要約: 組織学的解析は組織構造や病理を理解する上で重要な役割を担っている。
2次元スライスから正確な3Dモデルを構築することは、組織変形、分割アーティファクト、画像技術における可変性、および一貫性のない照明のために依然として困難である。
本研究では,ゼロレグ3D(ゼロレグ3D,ゼロレグ3D,ゼロレグ3D,ゼロレグ3D,ゼロレグ3D)を導入した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.590139868966619
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Histological analysis plays a crucial role in understanding tissue structure and pathology. While recent advancements in registration methods have improved 2D histological analysis, they often struggle to preserve critical 3D spatial relationships, limiting their utility in both clinical and research applications. Specifically, constructing accurate 3D models from 2D slices remains challenging due to tissue deformation, sectioning artifacts, variability in imaging techniques, and inconsistent illumination. Deep learning-based registration methods have demonstrated improved performance but suffer from limited generalizability and require large-scale training data. In contrast, non-deep-learning approaches offer better generalizability but often compromise on accuracy. In this study, we introduced ZeroReg3D, a novel zero-shot registration pipeline tailored for accurate 3D reconstruction from serial histological sections. By combining zero-shot deep learning-based keypoint matching with optimization-based affine and non-rigid registration techniques, ZeroReg3D effectively addresses critical challenges such as tissue deformation, sectioning artifacts, staining variability, and inconsistent illumination without requiring retraining or fine-tuning. The code has been made publicly available at https://github.com/hrlblab/ZeroReg3D
- Abstract(参考訳): 組織学的解析は組織構造や病理を理解する上で重要な役割を担っている。
近年の登録方法の進歩は2次元組織学的解析を改善しているが, 臨床応用と研究応用の両面で有用性を制限するため, 重要な3次元空間的関係の維持に苦慮することが多い。
具体的には、2次元スライスから正確な3Dモデルを構築することは、組織変形、分割アーティファクト、画像技術における可変性、および一貫性のない照明のために依然として困難である。
深層学習に基づく登録手法は性能の向上を実証しているが、一般化性に限界があり、大規模なトレーニングデータを必要とする。
対照的に、非深層学習アプローチはより優れた一般化性を提供するが、しばしば精度を損なう。
本研究では,ゼロレグ3D(ゼロレグ3D,ゼロレグ3D,ゼロレグ3D,ゼロレグ3D,ゼロレグ3D)を導入した。
ZeroReg3Dは、ゼロショットのディープラーニングベースのキーポイントマッチングと最適化ベースのアフィンと非厳密な登録技術を組み合わせることで、組織変形、断片化アーティファクト、染色のばらつき、一貫性のない照明といった重要な課題に、リトレーニングや微調整を必要とせずに効果的に対処する。
コードはhttps://github.com/hrlblab/ZeroReg3Dで公開されている。
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