論文の概要: Return of the Latent Space COWBOYS: Re-thinking the use of VAEs for Bayesian Optimisation of Structured Spaces
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.03910v1
- Date: Sat, 05 Jul 2025 05:53:04 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-08 15:46:34.933405
- Title: Return of the Latent Space COWBOYS: Re-thinking the use of VAEs for Bayesian Optimisation of Structured Spaces
- Title(参考訳): 潜在宇宙COWBOYSの復活:構造空間のベイズ最適化のためのVAEの利用を再考する
- Authors: Henry B. Moss, Sebastian W. Ober, Tom Diethe,
- Abstract要約: 本稿では、生成モデルとガウス過程(GP)を個別にシュロゲートし、単純だが原理化されたベイズ更新規則を介してそれらを結合する分離されたアプローチを提案する。
我々は, 分子最適化問題における高ポテンシャル候補を制約評価予算下で同定する能力を, 分離した手法により向上することを示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.38402522324075
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Bayesian optimisation in the latent space of a Variational AutoEncoder (VAE) is a powerful framework for optimisation tasks over complex structured domains, such as the space of scientifically interesting molecules. However, existing approaches tightly couple the surrogate and generative models, which can lead to suboptimal performance when the latent space is not tailored to specific tasks, which in turn has led to the proposal of increasingly sophisticated algorithms. In this work, we explore a new direction, instead proposing a decoupled approach that trains a generative model and a Gaussian Process (GP) surrogate separately, then combines them via a simple yet principled Bayesian update rule. This separation allows each component to focus on its strengths -- structure generation from the VAE and predictive modelling by the GP. We show that our decoupled approach improves our ability to identify high-potential candidates in molecular optimisation problems under constrained evaluation budgets.
- Abstract(参考訳): 変分オートエンコーダ(VAE)の潜伏空間におけるベイズ最適化は、科学的に興味深い分子の空間のような複雑な構造ドメイン上のタスクを最適化するための強力なフレームワークである。
しかし、既存のアプローチではサロゲートモデルと生成モデルが密接に結合しており、潜在空間が特定のタスクに適合しない場合、最適以下の性能をもたらす可能性があるため、アルゴリズムの高度化が提案されている。
本研究では、生成モデルとガウス過程(GP)を個別にシュロゲートする分離されたアプローチを提案し、単純だが原理化されたベイズ更新規則を介してそれらを結合する。
この分離により、各コンポーネントはその強度 - VAEからの構造生成とGPによる予測モデリング - に集中することができる。
我々は, 分子最適化問題において, 制約付き評価予算下でのポテンシャルの高い候補を同定する能力を, 分離した手法により向上することを示した。
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