論文の概要: Towards Robust Foundation Models for Digital Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.17845v1
- Date: Tue, 22 Jul 2025 16:51:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-25 15:10:42.335495
- Title: Towards Robust Foundation Models for Digital Pathology
- Title(参考訳): デジタル病理学のためのロバスト基礎モデルに向けて
- Authors: Jonah Kömen, Edwin D. de Jong, Julius Hense, Hannah Marienwald, Jonas Dippel, Philip Naumann, Eric Marcus, Lukas Ruff, Maximilian Alber, Jonas Teuwen, Frederick Klauschen, Klaus-Robert Müller,
- Abstract要約: 本研究は,非生物学的特徴に対するFMロバスト性に関する最初の系統的研究である。
PathoROBは3つの新しいメトリクスを持つロバストネスベンチマークである。
その結果,非破壊的FM表現は下流の誤診や臨床症状の原因となることが判明した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.717000308207425
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Biomedical Foundation Models (FMs) are rapidly transforming AI-enabled healthcare research and entering clinical validation. However, their susceptibility to learning non-biological technical features -- including variations in surgical/endoscopic techniques, laboratory procedures, and scanner hardware -- poses risks for clinical deployment. We present the first systematic investigation of pathology FM robustness to non-biological features. Our work (i) introduces measures to quantify FM robustness, (ii) demonstrates the consequences of limited robustness, and (iii) proposes a framework for FM robustification to mitigate these issues. Specifically, we developed PathoROB, a robustness benchmark with three novel metrics, including the robustness index, and four datasets covering 28 biological classes from 34 medical centers. Our experiments reveal robustness deficits across all 20 evaluated FMs, and substantial robustness differences between them. We found that non-robust FM representations can cause major diagnostic downstream errors and clinical blunders that prevent safe clinical adoption. Using more robust FMs and post-hoc robustification considerably reduced (but did not yet eliminate) the risk of such errors. This work establishes that robustness evaluation is essential for validating pathology FMs before clinical adoption and demonstrates that future FM development must integrate robustness as a core design principle. PathoROB provides a blueprint for assessing robustness across biomedical domains, guiding FM improvement efforts towards more robust, representative, and clinically deployable AI systems that prioritize biological information over technical artifacts.
- Abstract(参考訳): バイオメディカル・ファンデーション・モデル(FM)は、AI可能な医療研究を急速に変革させ、臨床検査に入る。
しかし、外科的・内視鏡的手法、検査手順、スキャナーハードウェアのバリエーションを含む、非生物学的技術的特徴の学習への感受性は、臨床展開のリスクを生じさせる。
本研究は,非生物学的特徴に対するFMロバスト性に関する最初の系統的研究である。
作品
一 FMロバスト性を定量化する措置を導入すること。
(二)頑丈さの限界の結果を示し、
(iii)これらの問題を緩和するためのFMロバスト化のためのフレームワークを提案する。
具体的には、ロバストネス指標を含む3つの新しい指標と、34の医療センターから28の生物学的クラスをカバーする4つのデータセットを備えたロバストネスベンチマークであるPathoROBを開発した。
実験の結果,評価されたFM20種すべてに頑健性障害がみられ,その間に有意なロバスト性差が認められた。
その結果,非破壊的FM表現は,診断上の誤りや臨床的失敗を招き,安全な臨床応用を阻害する可能性が示唆された。
より堅牢なFMとポストホックのロバスト化を使用することで、そのようなエラーのリスクは大幅に減少した(しかし、まだ排除されなかった)。
本研究は,臨床導入前のFMの診断にロバスト性評価が不可欠であることが確認され,今後のFM開発がコア設計原則としてロバスト性を統合する必要があることを示す。
PathoROBは、バイオメディカルドメイン間の堅牢性を評価するための青写真を提供し、技術的アーティファクトよりも生物学的情報を優先するより堅牢で、代表的で、臨床的にデプロイ可能なAIシステムに向けたFM改善の取り組みを導く。
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