論文の概要: ECG Latent Feature Extraction with Autoencoders for Downstream Prediction Tasks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.00131v1
- Date: Thu, 31 Jul 2025 19:37:05 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-04 18:08:53.65255
- Title: ECG Latent Feature Extraction with Autoencoders for Downstream Prediction Tasks
- Title(参考訳): 下流予測タスクのためのオートエンコーダを用いたECG潜時特徴抽出
- Authors: Christopher Harvey, Sumaiya Shomaji, Zijun Yao, Amit Noheria,
- Abstract要約: 心電図(Electrocardiogram、ECG)は、安価で広く用いられる心臓評価用ツールである。
標準化されたフォーマットと小さなファイルサイズにもかかわらず、ECG信号の複雑さと個人間変動は、ディープラーニングモデルでの使用を困難にしている。
本研究は,代表的ビート心電図から特徴生成手法を探索することにより,これらの課題に対処する。
本稿では,3つの新しい変分自動エンコーダ(VAE)-Stochastic Autoencoder (SAE), Annealed beta-VAE (A beta-VAE), Cyclical beta VAE (C beta-VAE)を導入し,それらの維持効果を比較した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.2616169634370076
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The electrocardiogram (ECG) is an inexpensive and widely available tool for cardiac assessment. Despite its standardized format and small file size, the high complexity and inter-individual variability of ECG signals (typically a 60,000-size vector with 12 leads at 500 Hz) make it challenging to use in deep learning models, especially when only small training datasets are available. This study addresses these challenges by exploring feature generation methods from representative beat ECGs, focusing on Principal Component Analysis (PCA) and Autoencoders to reduce data complexity. We introduce three novel Variational Autoencoder (VAE) variants-Stochastic Autoencoder (SAE), Annealed beta-VAE (A beta-VAE), and Cyclical beta VAE (C beta-VAE)-and compare their effectiveness in maintaining signal fidelity and enhancing downstream prediction tasks using a Light Gradient Boost Machine (LGBM). The A beta-VAE achieved superior signal reconstruction, reducing the mean absolute error (MAE) to 15.7+/-3.2 muV, which is at the level of signal noise. Moreover, the SAE encodings, when combined with traditional ECG summary features, improved the prediction of reduced Left Ventricular Ejection Fraction (LVEF), achieving an holdout test set area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) of 0.901 with a LGBM classifier. This performance nearly matches the 0.909 AUROC of state-of-the-art CNN model but requires significantly less computational resources. Further, the ECG feature extraction-LGBM pipeline avoids overfitting and retains predictive performance when trained with less data. Our findings demonstrate that these VAE encodings are not only effective in simplifying ECG data but also provide a practical solution for applying deep learning in contexts with limited-scale labeled training data.
- Abstract(参考訳): 心電図(Electrocardiogram、ECG)は、安価で広く用いられる心臓評価用ツールである。
標準化されたフォーマットと小さなファイルサイズにもかかわらず、ECG信号(通常、12個のリードを500Hzで持つ6万サイズのベクトル)の複雑さと個人間変動は、ディープラーニングモデルでの使用を困難にしている。
本研究は,PCA(Principal Component Analysis, 主成分分析)とオートエンコーダ(Autoencoder, 自動エンコーダ)に着目し,データ複雑性の低減を図ることで,これらの課題に対処する。
本稿では,3つの新しい変分自動エンコーダ(VAE)の変分自動エンコーダ(SAE),Annealed beta-VAE(A beta-VAE),Cyclical beta VAE(C beta-VAE)を導入し,信号の忠実性維持と,光グラディエントブーストマシン(LGBM)を用いた下流予測タスクの強化について比較した。
Aβ-VAEは、信号ノイズのレベルである平均絶対誤差(MAE)を15.7+/-3.2 muVに減らした。
さらに、SAEエンコーディングは、従来の心電図の要約機能と組み合わせることで、左室誘発率の低下(LVEF)の予測を改善し、LGBM分類器で0.901の受信動作特性曲線(AUROC)のホールドアウトテストセット領域を達成した。
この性能は最先端CNNモデルの0.909 AUROCとほぼ一致しているが、計算資源は大幅に少ない。
さらに、ECG特徴抽出-LGBMパイプラインは、少ないデータでトレーニングされた場合の過度な適合を回避し、予測性能を維持する。
以上の結果から,これらのVAE符号化はECGデータの簡易化だけでなく,限定的なラベル付き学習データを用いた文脈での深層学習の実践的解決にも有効であることが示唆された。
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