論文の概要: AdvDINO: Domain-Adversarial Self-Supervised Representation Learning for Spatial Proteomics
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.04955v1
- Date: Thu, 07 Aug 2025 00:51:54 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-08 18:59:39.674402
- Title: AdvDINO: Domain-Adversarial Self-Supervised Representation Learning for Spatial Proteomics
- Title(参考訳): AdvDINO:空間プロテオミクスのためのドメイン対逆自己スーパービジョン表現学習
- Authors: Stella Su, Marc Harary, Scott J. Rodig, William Lotter,
- Abstract要約: 自己教師付き学習(SSL)は、手動のアノテーションなしで視覚表現を学習するための強力なアプローチとして登場した。
本稿では,ドメイン逆転層をDINOv2アーキテクチャに統合し,ドメイン不変の特徴学習を促進するドメイン逆転型自己教師型学習フレームワークAdvDINOを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.42855555838080833
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Self-supervised learning (SSL) has emerged as a powerful approach for learning visual representations without manual annotations. However, the robustness of standard SSL methods to domain shift -- systematic differences across data sources -- remains uncertain, posing an especially critical challenge in biomedical imaging where batch effects can obscure true biological signals. We present AdvDINO, a domain-adversarial self-supervised learning framework that integrates a gradient reversal layer into the DINOv2 architecture to promote domain-invariant feature learning. Applied to a real-world cohort of six-channel multiplex immunofluorescence (mIF) whole slide images from non-small cell lung cancer patients, AdvDINO mitigates slide-specific biases to learn more robust and biologically meaningful representations than non-adversarial baselines. Across $>5.46$ million mIF image tiles, the model uncovers phenotype clusters with distinct proteomic profiles and prognostic significance, and improves survival prediction in attention-based multiple instance learning. While demonstrated on mIF data, AdvDINO is broadly applicable to other imaging domains -- including radiology, remote sensing, and autonomous driving -- where domain shift and limited annotated data hinder model generalization and interpretability.
- Abstract(参考訳): 自己教師付き学習(SSL)は、手動のアノテーションなしで視覚表現を学習するための強力なアプローチとして登場した。
しかし、標準SSLメソッドのドメインシフトに対する堅牢性 -- データソース間の体系的な違い -- は依然として不確実であり、バッチ効果が真の生物学的シグナルを隠蔽するバイオメディカルイメージングにおいて特に重要な課題となっている。
本稿では,ドメイン逆転層をDINOv2アーキテクチャに統合し,ドメイン不変の特徴学習を促進するドメイン逆転型自己教師型学習フレームワークAdvDINOを提案する。
AdvDINOは、非小細胞肺癌患者の6チャンネル多重蛍光(mIF)全スライド画像の現実世界コホートに応用し、スライド特異的バイアスを緩和し、非敵ベースラインよりも堅牢で生物学的に有意義な表現を学習する。
5.46億ドルのMIF画像タイルを網羅して、このモデルはプロテオミクスプロファイルと予後上の意義を持つ表現型クラスタを発見し、注意に基づく複数インスタンス学習における生存予測を改善する。
mIFデータで実証されているが、AdvDINOは他の画像領域(放射線学、リモートセンシング、自律運転など)にも適用可能である。
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