論文の概要: CISO: Species Distribution Modeling Conditioned on Incomplete Species Observations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.06704v1
- Date: Fri, 08 Aug 2025 21:15:12 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-12 21:23:28.516135
- Title: CISO: Species Distribution Modeling Conditioned on Incomplete Species Observations
- Title(参考訳): CISO:不完全種観測に基づく種分布モデリング
- Authors: Hager Radi Abdelwahed, Mélisande Teng, Robin Zbinden, Laura Pollock, Hugo Larochelle, Devis Tuia, David Rolnick,
- Abstract要約: 種分布モデル(SDM)は、種の地理的分布を予測するために広く用いられている。
CSISは、不完全種観測に基づく種分布モデリングのための深層学習に基づく手法である。
我々は,異なる種群を表す3つのデータセットを用いたアプローチを実証した。植物のためのsOpen,鳥類のためのSatBird,蝶のためのSatButterfly。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 31.010868781061006
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Species distribution models (SDMs) are widely used to predict species' geographic distributions, serving as critical tools for ecological research and conservation planning. Typically, SDMs relate species occurrences to environmental variables representing abiotic factors, such as temperature, precipitation, and soil properties. However, species distributions are also strongly influenced by biotic interactions with other species, which are often overlooked. While some methods partially address this limitation by incorporating biotic interactions, they often assume symmetrical pairwise relationships between species and require consistent co-occurrence data. In practice, species observations are sparse, and the availability of information about the presence or absence of other species varies significantly across locations. To address these challenges, we propose CISO, a deep learning-based method for species distribution modeling Conditioned on Incomplete Species Observations. CISO enables predictions to be conditioned on a flexible number of species observations alongside environmental variables, accommodating the variability and incompleteness of available biotic data. We demonstrate our approach using three datasets representing different species groups: sPlotOpen for plants, SatBird for birds, and a new dataset, SatButterfly, for butterflies. Our results show that including partial biotic information improves predictive performance on spatially separate test sets. When conditioned on a subset of species within the same dataset, CISO outperforms alternative methods in predicting the distribution of the remaining species. Furthermore, we show that combining observations from multiple datasets can improve performance. CISO is a promising ecological tool, capable of incorporating incomplete biotic information and identifying potential interactions between species from disparate taxa.
- Abstract(参考訳): 種分布モデル(SDM)は、生物の地理的分布を予測するために広く使われており、生態学的研究と保全計画の重要なツールとなっている。
典型的には、SDMは温度、降水量、土壌特性などの非生物的要因を表す環境変数に種の発生を関連付ける。
しかし、種分布は、しばしば見落とされがちな他の種との生物的相互作用にも強く影響される。
生物相互作用を組み込むことでこの制限に部分的に対処する手法もあるが、それらはしばしば種間の対称的な対関係を仮定し、一貫性のある共起データを必要とする。
実際には、種観測は希少であり、他の種の存在や欠如に関する情報の入手は、場所によって大きく異なる。
これらの課題に対処するために,不完全種数観測に基づく種分布モデリングのための深層学習に基づくCISOを提案する。
CISOは、利用可能な生物データの多様性と不完全性を調節し、環境変数と並行して、フレキシブルな数の種観測で予測できる。
我々は,異なる種群を表す3つのデータセットを用いたアプローチを実証した。植物はsPlotOpen,鳥はSatBird,蝶はSatButterflyである。
実験結果から, 部分的バイオティクス情報を含むと, 空間的に分離したテストセットの予測性能が向上することがわかった。
同じデータセット内の種のサブセットに条件付けされた場合、CISOは残りの種の分布を予測する別の方法よりも優れている。
さらに,複数のデータセットからの観測を組み合わせることで,性能が向上することを示す。
CISOは有望な生態ツールであり、不完全な生物情報を取り込んで、異なる分類群からの種間の潜在的な相互作用を特定することができる。
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