論文の概要: IPGPhormer: Interpretable Pathology Graph-Transformer for Survival Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.12381v1
- Date: Sun, 17 Aug 2025 14:32:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-19 14:49:10.709894
- Title: IPGPhormer: Interpretable Pathology Graph-Transformer for Survival Analysis
- Title(参考訳): IPGPhormer:生存分析のための解釈可能な病理グラフ変換器
- Authors: Guo Tang, Songhan Jiang, Jinpeng Lu, Linghan Cai, Yongbing Zhang,
- Abstract要約: 腫瘍の微小環境の特徴を捉え,組織全体にわたる空間的依存関係をモデル化する新しい枠組みを提案する。
IPGPhormerは、ホック後の手動のアノテーションを必要とせずに、組織と細胞レベルでの解釈性を提供する。
4つの公開ベンチマークデータセットの総合的な評価は、IPGPhormerが予測精度と解釈可能性の両方で最先端の手法より優れていることを示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.753315684414596
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Pathological images play an essential role in cancer prognosis, while survival analysis, which integrates computational techniques, can predict critical clinical events such as patient mortality or disease recurrence from whole-slide images (WSIs). Recent advancements in multiple instance learning have significantly improved the efficiency of survival analysis. However, existing methods often struggle to balance the modeling of long-range spatial relationships with local contextual dependencies and typically lack inherent interpretability, limiting their clinical utility. To address these challenges, we propose the Interpretable Pathology Graph-Transformer (IPGPhormer), a novel framework that captures the characteristics of the tumor microenvironment and models their spatial dependencies across the tissue. IPGPhormer uniquely provides interpretability at both tissue and cellular levels without requiring post-hoc manual annotations, enabling detailed analyses of individual WSIs and cross-cohort assessments. Comprehensive evaluations on four public benchmark datasets demonstrate that IPGPhormer outperforms state-of-the-art methods in both predictive accuracy and interpretability. In summary, our method, IPGPhormer, offers a promising tool for cancer prognosis assessment, paving the way for more reliable and interpretable decision-support systems in pathology. The code is publicly available at https://anonymous.4open.science/r/IPGPhormer-6EEB.
- Abstract(参考訳): 病理画像は癌予後において重要な役割を担っているが、生存分析は計算技術を統合しており、患者死亡や全スライディング画像(WSI)からの疾患再発などの重要な臨床事象を予測することができる。
複数インスタンス学習の最近の進歩は、生存率分析の効率を大幅に改善した。
しかし、既存の手法はしばしば、局所的な文脈依存と長距離空間関係のモデリングのバランスをとるのに苦労し、典型的には固有の解釈可能性に欠け、臨床効果を制限している。
これらの課題に対処するために,腫瘍の微小環境の特徴を捉え,組織全体にわたる空間的依存関係をモデル化する新しいフレームワークであるIPGPhormerを提案する。
IPGPhormerは、ポストホックな手動アノテーションを必要とせず、組織と細胞レベルでの解釈可能性を提供し、個々のWSIの詳細な分析とクロスコホートアセスメントを可能にする。
4つの公開ベンチマークデータセットの総合的な評価は、IPGPhormerが予測精度と解釈可能性の両方で最先端の手法より優れていることを示している。
まとめると,IPGPhormerは癌予後評価のための有望なツールであり,病理学におけるより信頼性が高く解釈可能な意思決定支援システムを実現する。
コードはhttps://anonymous.4open.science/r/IPGPhormer-6EEBで公開されている。
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