論文の概要: Random forest-based out-of-distribution detection for robust lung cancer segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2508.19112v1
- Date: Tue, 26 Aug 2025 15:14:29 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-08-27 17:42:38.89834
- Title: Random forest-based out-of-distribution detection for robust lung cancer segmentation
- Title(参考訳): 無作為な肺がんセグメンテーションのためのランダムフォレストを用いたアウト・オブ・ディストリビューション検出法
- Authors: Aneesh Rangnekar, Harini Veeraraghavan,
- Abstract要約: 自己教師付き事前トレーニングを備えたトランスフォーマーベースのモデルでは、In-distriion (ID)データから確実に正確なセグメンテーションを生成することができるが、out-of-distriion (OOD)データセットに適用すると劣化する。
この課題に対処するRF-Deepは、セグメンテーションモデルの事前訓練されたトランスフォーマーエンコーダの深い特徴を利用して、OODスキャンを検出し、セグメンテーション信頼性を向上させるランダム森林分類器である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.6825994665041235
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate detection and segmentation of cancerous lesions from computed tomography (CT) scans is essential for automated treatment planning and cancer treatment response assessment. Transformer-based models with self-supervised pretraining can produce reliably accurate segmentation from in-distribution (ID) data but degrade when applied to out-of-distribution (OOD) datasets. We address this challenge with RF-Deep, a random forest classifier that utilizes deep features from a pretrained transformer encoder of the segmentation model to detect OOD scans and enhance segmentation reliability. The segmentation model comprises a Swin Transformer encoder, pretrained with masked image modeling (SimMIM) on 10,432 unlabeled 3D CT scans covering cancerous and non-cancerous conditions, with a convolution decoder, trained to segment lung cancers in 317 3D scans. Independent testing was performed on 603 3D CT public datasets that included one ID dataset and four OOD datasets comprising chest CTs with pulmonary embolism (PE) and COVID-19, and abdominal CTs with kidney cancers and healthy volunteers. RF-Deep detected OOD cases with a FPR95 of 18.26%, 27.66%, and less than 0.1% on PE, COVID-19, and abdominal CTs, consistently outperforming established OOD approaches. The RF-Deep classifier provides a simple and effective approach to enhance reliability of cancer segmentation in ID and OOD scenarios.
- Abstract(参考訳): CT(Computed tomography)スキャンによる癌病変の正確な検出と分節化は,自動治療計画と癌治療対応評価に不可欠である。
自己教師付き事前トレーニングを持つトランスフォーマーベースのモデルは、分布内(ID)データから確実に正確なセグメンテーションを生成することができるが、分布外(OOD)データセットに適用すると劣化する。
この課題に対処するRF-Deepは、セグメンテーションモデルの事前訓練されたトランスフォーマーエンコーダの深い特徴を利用して、OODスキャンを検出し、セグメンテーション信頼性を向上させるランダム森林分類器である。
スウィントランスフォーマーエンコーダ(SimMIM)を10,432個の無ラベルの3DCTスキャンでプリトレーニングし、癌および非癌状態をカバーし、肺がんを317個の3Dスキャンで分画する畳み込みデコーダ(convolution decoder)を備える。
肺塞栓症(PE)と新型コロナウイルス(COVID-19)の胸部CTを含む1つのIDデータセットと4つのOODデータセットと、腎臓がんと健常なボランティアの腹部CTを含む603個の3D CTパブリックデータセットで独立した試験を行った。
FPR95が18.26%、27.66%、PE、COVID-19、腹部CTで0.1%未満の症例がRFディープで検出された。
RFディープ分類器は、IDおよびOODシナリオにおける癌セグメンテーションの信頼性を高めるためのシンプルで効果的なアプローチを提供する。
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