論文の概要: Prediction, Generation of WWTPs microbiome community structures and Clustering of WWTPs various feature attributes using DE-BP model, SiTime-GAN model and DPNG-EPMC ensemble clustering algorithm with modulation of microbial ecosystem health
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.01526v1
- Date: Mon, 01 Sep 2025 15:00:50 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-04 15:17:03.73866
- Title: Prediction, Generation of WWTPs microbiome community structures and Clustering of WWTPs various feature attributes using DE-BP model, SiTime-GAN model and DPNG-EPMC ensemble clustering algorithm with modulation of microbial ecosystem health
- Title(参考訳): DE-BPモデル, SiTime-GANモデル, DPNG-EPMCアンサンブルクラスタリングアルゴリズムを用いた微生物群集の予測, 生成とWWTPのクラスタリング
- Authors: Mingzhi Dai, Weiwei Cai, Xiang Feng, Huiqun Yu, Weibin Guo, Miao Guo,
- Abstract要約: 逆伝播ニューラルネットワーク (BPNN) を用いて, 活性汚泥 (AS) の微生物組成を予測する。
また,DPNG-MCEP(Directional Position Emotional Migration Clustering)と呼ばれる新たなクラスタリングアルゴリズムを導入する。
本研究は, 微生物群集の予測と, 諸特性に基づくWWTPの分析により得られた知見から, AS群集に影響を与える要因の理解を深めた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.059919783074228
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Microbiomes not only underpin Earth's biogeochemical cycles but also play crucial roles in both engineered and natural ecosystems, such as the soil, wastewater treatment, and the human gut. However, microbiome engineering faces significant obstacles to surmount to deliver the desired improvements in microbiome control. Here, we use the backpropagation neural network (BPNN), optimized through differential evolution (DE-BP), to predict the microbial composition of activated sludge (AS) systems collected from wastewater treatment plants (WWTPs) located worldwide. Furthermore, we introduce a novel clustering algorithm termed Directional Position Nonlinear Emotional Preference Migration Behavior Clustering (DPNG-EPMC). This method is applied to conduct a clustering analysis of WWTPs across various feature attributes. Finally, we employ the Similar Time Generative Adversarial Networks (SiTime-GAN), to synthesize novel microbial compositions and feature attributes data. As a result, we demonstrate that the DE-BP model can provide superior predictions of the microbial composition. Additionally, we show that the DPNG-EPMC can be applied to the analysis of WWTPs under various feature attributes. Finally, we demonstrate that the SiTime-GAN model can generate valuable incremental synthetic data. Our results, obtained through predicting the microbial community and conducting analysis of WWTPs under various feature attributes, develop an understanding of the factors influencing AS communities.
- Abstract(参考訳): 微生物は地球の生物地球化学的サイクルを支えているだけでなく、土壌、排水処理、ヒトの腸といった工学的・自然的な生態系でも重要な役割を担っている。
しかし、微生物工学は、望まれる微生物制御の改善をもたらすために、非常に大きな障害に直面している。
そこで我々は, 世界の排水処理プラント (WWTP) から採取した活性汚泥 (AS) の微生物組成を予測するために, 差分進化 (DE-BP) により最適化されたバックプロパゲーションニューラルネットワーク (BPNN) を用いた。
さらに,DPNG-EPMC(Directional Position Nonly Emotional Preference Migration Clustering)と呼ばれる新たなクラスタリングアルゴリズムを導入する。
本手法を用いて,WWTPのクラスタリング解析を行った。
最後に、Simisal Time Generative Adversarial Networks (SiTime-GAN)を用いて、新規な微生物組成と特徴属性データを合成する。
その結果,DE-BPモデルは微生物組成の予測に優れることを示した。
さらに, DPNG-EPMCは, 各種特徴量に基づくWWTPの解析に適用可能であることを示す。
最後に、SiTime-GANモデルが貴重なインクリメンタルな合成データを生成できることを実証する。
本研究は, 微生物群集の予測と, 諸特性に基づくWWTPの分析により得られた知見から, AS群集に影響を与える要因の理解を深めた。
関連論文リスト
- EnviroPiNet: A Physics-Guided AI Model for Predicting Biofilter Performance [0.9895793818721335]
本稿では,Buckingham Pi理論のバイオフィルタ性能のモデル化への応用について述べる。
この次元削減技術は、予測精度を高める意味のある無次元変数を識別する。
本研究では,従来のデータ駆動方式と比較した物理誘導モデルであるEnviroPiNetを開発した。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-04-24T13:52:51Z) - Meta Flow Matching: Integrating Vector Fields on the Wasserstein Manifold [83.18058549195855]
自然科学における複数の過程は、確率密度のワッサーシュタイン多様体上のベクトル場として表さなければならない。
特に、疾患の発生とその治療反応が患者固有の細胞の微小環境に依存するパーソナライズド医療において重要である。
本稿では,初期個体群上の流れモデルを改善することで,ワッサーシュタイン多様体上のこれらのベクトル場と一体化するためのメタフローマッチング(MFM)を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-08-26T20:05:31Z) - MAPE-PPI: Towards Effective and Efficient Protein-Protein Interaction
Prediction via Microenvironment-Aware Protein Embedding [82.31506767274841]
タンパク質-プロテイン相互作用(PPI)は、様々な生物学的過程において基本的であり、生命活動において重要な役割を果たしている。
MPAE-PPIは、十分に大きな「語彙」を介して、マイクロ環境を化学的に意味のある離散コードに符号化する
MPAE-PPIは、数百万のPPIでPPI予測にスケールでき、有効性と計算効率のトレードオフが優れている。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-02-22T09:04:41Z) - Evaluation of Activated Sludge Settling Characteristics from Microscopy Images with Deep Convolutional Neural Networks and Transfer Learning [7.636901972162706]
本研究では, 活性汚泥沈降特性を評価するために, コンピュータビジョンに基づく革新的な手法を提案する。
深層畳み込みニューラルネットワーク(CNN)モデルの伝達学習の実装により,既存の定量的画像解析技術の限界を克服することを目的とした。
Inception v3, ResNet18, ResNet152, ConvNeXt-nano, ConvNeXt-S などのCNNアーキテクチャを用いて, 汚泥沈降特性の評価を行った。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-02-14T18:13:37Z) - Human Limits in Machine Learning: Prediction of Plant Phenotypes Using
Soil Microbiome Data [0.2812395851874055]
我々は,土壌と生物表現型との関係を理解するために,機械学習モデルの予測可能性について,初めて深く研究した。
土壌物理化学的特性や微生物集団密度などの環境特性をモデルに組み込んだ場合, 予測精度が向上することを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-06-19T20:52:37Z) - Three-dimensional microstructure generation using generative adversarial
neural networks in the context of continuum micromechanics [77.34726150561087]
本研究は, 三次元マイクロ構造生成に適した生成対向ネットワークを提案する。
軽量アルゴリズムは、明示的な記述子を必要とせずに、単一のmicroCTスキャンから材料の基礎特性を学習することができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-05-31T13:26:51Z) - Graph Neural Networks for Microbial Genome Recovery [64.91162205624848]
本稿では,グラフニューラルネットワーク(GNN)を用いて,メダゲノミクスビニングのためのコンティグ表現を学習する際のアセンブリグラフを活用することを提案する。
提案手法であるVaeG-Binは,個々のコンティグの潜在表現を学習するための変分オートエンコーダと,アセンブリグラフ内のコンティグの近傍構造を考慮したGNNを組み合わせる。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-04-26T12:49:51Z) - Towards an Automatic Analysis of CHO-K1 Suspension Growth in
Microfluidic Single-cell Cultivation [63.94623495501023]
我々は、人間の力で抽象化されたニューラルネットワークをデータレベルで注入できる新しい機械学習アーキテクチャを提案する。
具体的には、自然データと合成データに基づいて生成モデルを同時に訓練し、細胞数などの対象変数を確実に推定できる共有表現を学習する。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-10-20T08:36:51Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。