論文の概要: Predicting effect of novel treatments using molecular pathways and real-world data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.07204v1
- Date: Mon, 08 Sep 2025 20:35:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-10 14:38:27.11349
- Title: Predicting effect of novel treatments using molecular pathways and real-world data
- Title(参考訳): 分子経路と実世界のデータを用いた新規治療の予測
- Authors: Adrien Couetoux, Thomas Devenyns, Lise Diagne, David Champagne, Pierre-Yves Mousset, Chris Anagnostopoulos,
- Abstract要約: 本稿では、未試験薬品の病気治療効果を予測するための、フレキシブルでモジュラーな機械学習ベースのアプローチを提案する。
我々は、薬道重量影響スコアと患者データを用いて機械学習モデルを訓練する。
得られたモデルは、ヒトの生物学的分子-タンパク質経路にまたがる未試験薬品の重み付けされた衝撃スコアを分析し、予測された有効値を生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: In pharmaceutical R&D, predicting the efficacy of a pharmaceutical in treating a particular disease prior to clinical testing or any real-world use has been challenging. In this paper, we propose a flexible and modular machine learning-based approach for predicting the efficacy of an untested pharmaceutical for treating a disease. We train a machine learning model using sets of pharmaceutical-pathway weight impact scores and patient data, which can include patient characteristics and observed clinical outcomes. The resulting model then analyses weighted impact scores of an untested pharmaceutical across human biological molecule-protein pathways to generate a predicted efficacy value. We demonstrate how the method works on a real-world dataset with patient treatments and outcomes, with two different weight impact score algorithms We include methods for evaluating the generalisation performance on unseen treatments, and to characterise conditions under which the approach can be expected to be most predictive. We discuss specific ways in which our approach can be iterated on, making it an initial framework to support future work on predicting the effect of untested drugs, leveraging RWD clinical data and drug embeddings.
- Abstract(参考訳): 医薬R&Dでは、臨床検査または実際の使用前に特定の疾患を治療するための薬剤の有効性を予測することが困難である。
本稿では、未試験薬品の病気治療効果を予測するための、柔軟でモジュール化された機械学習に基づくアプローチを提案する。
我々は,患者の特徴と臨床結果の観察を含む患者データと薬道重量影響スコアのセットを用いて,機械学習モデルを訓練する。
得られたモデルは、ヒトの生物学的分子-タンパク質経路にまたがる未試験薬品の重み付けされた衝撃スコアを分析し、予測された有効値を生成する。
本手法は,2つの異なる重み付けスコアアルゴリズムを用いて,患者治療と結果を伴う実世界のデータセット上でどのように機能するかを実証する。
我々は,本手法を反復的に行うための具体的な方法について議論し,RWD 臨床データと薬物埋め込みを活用することにより,未試験薬物の効果を予測するための今後の研究を支援するための最初の枠組みについて論じる。
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