論文の概要: GraphDerm: Fusing Imaging, Physical Scale, and Metadata in a Population-Graph Classifier for Dermoscopic Lesions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.12277v1
- Date: Sun, 14 Sep 2025 08:11:54 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-17 17:50:52.672678
- Title: GraphDerm: Fusing Imaging, Physical Scale, and Metadata in a Population-Graph Classifier for Dermoscopic Lesions
- Title(参考訳): GraphDerm: 皮膚内視鏡的病変に対する集団グラフ分類器におけるイメージング, 物理スケール, メタデータ
- Authors: Mehdi Yousefzadeh, Parsa Esfahanian, Sara Rashidifar, Hossein Salahshoor Gavalan, Negar Sadat Rafiee Tabatabaee, Saeid Gorgin, Dara Rahmati, Maryam Daneshpazhooh,
- Abstract要約: 画像、ミリスケールキャリブレーション、分類のためのメタデータを融合した幾何学グラフフレームワークであるGraphDermを提案する。
我々は、病変と定規セグメンテーションのためにU-Netをトレーニングし、病変マスクからリアルタイムな記述子を計算する。
グラフは AUC 0.9812 に達し、AUC 0.9788 (画像のみのベースラインは 0.9440 ) のエッジの約25%をしきい値で保存し、クラスごとの到達範囲は 0.97-0.99 である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.30661374053736157
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Introduction. Dermoscopy aids melanoma triage, yet image-only AI often ignores patient metadata (age, sex, site) and the physical scale needed for geometric analysis. We present GraphDerm, a population-graph framework that fuses imaging, millimeter-scale calibration, and metadata for multiclass dermoscopic classification, to the best of our knowledge the first ISIC-scale application of GNNs to dermoscopy. Methods. We curate ISIC 2018/2019, synthesize ruler-embedded images with exact masks, and train U-Nets (SE-ResNet-18) for lesion and ruler segmentation. Pixels-per-millimeter are regressed from the ruler-mask two-point correlation via a lightweight 1D-CNN. From lesion masks we compute real-scale descriptors (area, perimeter, radius of gyration). Node features use EfficientNet-B3; edges encode metadata/geometry similarity (fully weighted or thresholded). A spectral GNN performs semi-supervised node classification; an image-only ANN is the baseline. Results. Ruler and lesion segmentation reach Dice 0.904 and 0.908; scale regression attains MAE 1.5 px (RMSE 6.6). The graph attains AUC 0.9812, with a thresholded variant using about 25% of edges preserving AUC 0.9788 (vs. 0.9440 for the image-only baseline); per-class AUCs typically fall in the 0.97-0.99 range. Conclusion. Unifying calibrated scale, lesion geometry, and metadata in a population graph yields substantial gains over image-only pipelines on ISIC-2019. Sparser graphs retain near-optimal accuracy, suggesting efficient deployment. Scale-aware, graph-based AI is a promising direction for dermoscopic decision support; future work will refine learned edge semantics and evaluate on broader curated benchmarks.
- Abstract(参考訳): はじめに。
皮膚内視鏡はメラノーマのトリアージを補助するが、画像のみのAIは患者のメタデータ(年齢、性別、場所)と幾何学的分析に必要な物理的なスケールを無視することが多い。
マルチクラス皮膚内視鏡分類のための画像,ミリスケールキャリブレーション,メタデータを融合したグラフグラフフレームワークであるGraphDermについて,第1回ISICスケールGNNの皮膚内視鏡への応用について考察した。
メソッド。
我々はISIC 2018/2019をキュレートし、正確なマスクで定規埋め込み画像を合成し、病変と定規セグメンテーションのためにU-Nets(SE-ResNet-18)を訓練する。
1ミリあたりの画素は、軽量1D-CNNを介して定規マスクの2点相関から回帰される。
病変マスクから、我々は実スケールディスクリプタ(エリア、周辺、ジャイレーション半径)を計算します。
ノード機能はEfficientNet-B3を使用し、エッジはメタデータ/ジオメトリの類似性をエンコードする(完全に重み付けまたはしきい値付き)。
スペクトルGNNは半教師付きノード分類を行い、画像のみのANNがベースラインとなる。
結果。
ルールと病変のセグメンテーションはDice 0.904と0.908に到達し、スケール回帰は MAE 1.5 px (RMSE 6.6) に達する。
グラフは AUC 0.9812 に達し、AUC 0.9788 (画像のみのベースラインは 0.9440 である) のエッジの約25%をしきい値で保存する。
結論。
人口グラフにおける校正スケール、病変形状、メタデータの統一は、ISIC-2019上の画像のみのパイプラインよりも大幅に向上する。
スペーサーグラフは最適に近い精度を維持し、効率的な配置を示唆する。
スケールアウェアでグラフベースのAIは、皮膚科の意思決定支援のための有望な方向であり、将来の研究は、学習されたエッジセマンティクスを洗練し、より広範なキュレートされたベンチマークで評価する。
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