論文の概要: A Machine Learning Framework for Pathway-Driven Therapeutic Target Discovery in Metabolic Disorders
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.18140v1
- Date: Sun, 14 Sep 2025 19:29:52 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-24 20:41:27.411697
- Title: A Machine Learning Framework for Pathway-Driven Therapeutic Target Discovery in Metabolic Disorders
- Title(参考訳): メタボリック障害における経路駆動療法ターゲット発見のための機械学習フレームワーク
- Authors: Iram Wajahat, Amritpal Singh, Fazel Keshtkar, Syed Ahmad Chan Bukhari,
- Abstract要約: 本研究では,遺伝子に依存しない経路マッピングと予測モデリングを統合し,リスクの高い個人を特定する新しい機械学習(ML)フレームワークを提案する。
ピマ・インディアンのデータセットを用いて、T2DMの重要な予測因子を特定するためにロジスティック回帰とt-testを適用し、全体のモデル精度は78.43%となった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.41678086736482
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Metabolic disorders, particularly type 2 diabetes mellitus (T2DM), represent a significant global health burden, disproportionately impacting genetically predisposed populations such as the Pima Indians (a Native American tribe from south central Arizona). This study introduces a novel machine learning (ML) framework that integrates predictive modeling with gene-agnostic pathway mapping to identify high-risk individuals and uncover potential therapeutic targets. Using the Pima Indian dataset, logistic regression and t-tests were applied to identify key predictors of T2DM, yielding an overall model accuracy of 78.43%. To bridge predictive analytics with biological relevance, we developed a pathway mapping strategy that links identified predictors to critical signaling networks, including insulin signaling, AMPK, and PPAR pathways. This approach provides mechanistic insights without requiring direct molecular data. Building upon these connections, we propose therapeutic strategies such as dual GLP-1/GIP receptor agonists, AMPK activators, SIRT1 modulators, and phytochemical, further validated through pathway enrichment analyses. Overall, this framework advances precision medicine by offering interpretable and scalable solutions for early detection and targeted intervention in metabolic disorders. The key contributions of this work are: (1) development of an ML framework combining logistic regression and principal component analysis (PCA) for T2DM risk prediction; (2) introduction of a gene-agnostic pathway mapping approach to generate mechanistic insights; and (3) identification of novel therapeutic strategies tailored for high-risk populations.
- Abstract(参考訳): メタボリック障害、特に2型糖尿病(T2DM)は、ピマ・インディアン(アリゾナ州南部から来たインディアン部族)のような遺伝的に未分化の集団に不均等に影響を与えている。
本研究では、遺伝子に依存しない経路マッピングと予測モデリングを統合し、リスクの高い個人を特定し、潜在的治療対象を明らかにする新しい機械学習(ML)フレームワークを提案する。
ピマ・インディアンのデータセットを用いて、T2DMの重要な予測因子を特定するためにロジスティック回帰とt-testを適用し、全体のモデル精度は78.43%となった。
生体関連性による予測分析を橋渡しするために,インスリンシグナル,AMPK,PPAR経路を含む重要なシグナルネットワークに同定された予測器をリンクする経路マッピング戦略を開発した。
このアプローチは直接的な分子データを必要としない機械的な洞察を与える。
本研究はGLP-1/GIP受容体アゴニスト,AMPKアクチベーター,SIRT1モジュレータ,植物化学などの治療戦略について,経路濃縮分析によりさらに検証した。
全体として、このフレームワークは、早期発見のための解釈可能でスケーラブルなソリューションと、代謝障害に対する標的的介入を提供することにより、精密医療を進歩させる。
本研究の主な貢献は,(1)T2DMリスク予測のためのロジスティック回帰と主成分分析(PCA)を組み合わせたMLフレームワークの開発,(2)機械的洞察を生成する遺伝子非依存経路マッピングアプローチの導入,(3)高リスク人口に適した新規な治療戦略の同定である。
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