論文の概要: spd-metrics-id: A Python Package for SPD-Aware Distance Metrics in Connectome Fingerprinting and Beyond
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.04438v1
- Date: Mon, 06 Oct 2025 02:12:55 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-07 16:52:59.649907
- Title: spd-metrics-id: A Python Package for SPD-Aware Distance Metrics in Connectome Fingerprinting and Beyond
- Title(参考訳): spd-metrics-id: Connectome FingerprintingおよびBeyondにおけるSPD対応距離メトリックのためのPythonパッケージ
- Authors: Kaosar Uddin,
- Abstract要約: spd-metrics-idは、SPD行列間の距離と発散を計算するPythonパッケージである。
このパッケージは、Alpha-z Bures-Wasserstein、Alpha-Procrustes、affine-invariantian、log-Euclideanなど、様々な幾何学的なメトリクスをサポートしている。
パッケージはhttps://pypi.org/project/spd-metrics-id/で公開されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We present spd-metrics-id, a Python package for computing distances and divergences between symmetric positive-definite (SPD) matrices. Unlike traditional toolkits that focus on specific applications, spd-metrics-id provides a unified, extensible, and reproducible framework for SPD distance computation. The package supports a wide variety of geometry-aware metrics, including Alpha-z Bures-Wasserstein, Alpha-Procrustes, affine-invariant Riemannian, log-Euclidean, and others, and is accessible both via a command-line interface and a Python API. Reproducibility is ensured through Docker images and Zenodo archiving. We illustrate usage through a connectome fingerprinting example, but the package is broadly applicable to covariance analysis, diffusion tensor imaging, and other domains requiring SPD matrix comparison. The package is openly available at https://pypi.org/project/spd-metrics-id/.
- Abstract(参考訳): 対称正定値行列間の距離と発散を計算するためのPythonパッケージであるspd-metrics-idを提案する。
特定のアプリケーションに焦点を当てた従来のツールキットとは異なり、spd-metrics-idはSPD距離計算のための統一的で拡張性があり再現可能なフレームワークを提供する。
Alpha-z Bures-Wasserstein, Alpha-Procrustes, affine-invariant Riemannian, log-Euclideanなど,さまざまな幾何学的メトリクスをサポートし,コマンドラインインターフェースとPython APIを通じてアクセス可能である。
再現性はDockerイメージとZenodoアーカイブを通じて保証される。
我々はコネクトームフィンガープリントの例を通して使用法を説明するが、このパッケージは共分散解析、拡散テンソルイメージング、その他のSPDマトリクス比較を必要とする領域に広く適用可能である。
パッケージはhttps://pypi.org/project/spd-metrics-id/で公開されている。
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