論文の概要: Development and Validation of a Low-Cost Imaging System for Seedling Germination Kinetics through Time-Cumulative Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.05668v1
- Date: Tue, 07 Oct 2025 08:26:11 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-08 17:57:08.156372
- Title: Development and Validation of a Low-Cost Imaging System for Seedling Germination Kinetics through Time-Cumulative Analysis
- Title(参考訳): 時間-累積解析による実生発芽動態の低速度イメージングシステムの開発と検証
- Authors: M. Torrente, A. Follador, A. Calcante, P. Casati, R. Oberti,
- Abstract要約: 本研究では,R. solani接種がLactuca sativa L. 種子の発芽と初期発生に及ぼす効果について,低コストで画像ベースのモニタリングシステムを用いて検討した。
結果,R. solani感染は発芽率と初期苗活力を大幅に低下させることが明らかとなった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.570530789849319
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The study investigates the effects of R. solani inoculation on the germination and early development of Lactuca sativa L. seeds using a low-cost, image-based monitoring system. Multiple cameras were deployed to continuously capture images of the germination process in both infected and control groups. The objective was to assess the impact of the pathogen by analyzing germination dynamics and growth over time. To achieve this, a novel image analysis pipeline was developed. The algorithm integrates both morphological and spatial features to identify and quantify individual seedlings, even under complex conditions where traditional image analyses fails. A key innovation of the method lies in its temporal integration: each analysis step considers not only the current status but also their developmental across prior time points. This approach enables robust discrimination of individual seedlings, especially when overlapping leaves significantly hinder object separation. The method demonstrated high accuracy in seedling counting and vigor assessment, even in challenging scenarios characterized by dense and intertwined growth. Results confirm that R. solani infection significantly reduces germination rates and early seedling vigor. The study also validates the feasibility of combining low-cost imaging hardware with advanced computational tools to obtain phenotyping data in a non-destructive and scalable manner. The temporal integration enabled accurate quantification of germinated seeds and precise determination of seedling emergence timing. This approach proved particularly effective in later stages of the experiment, where conventional segmentation techniques failed due to overlapping or intertwined seedlings, making accurate counting. The method achieved a coefficient of determination of 0.98 and a root mean square error (RMSE) of 1.12, demonstrating its robustness and reliability.
- Abstract(参考訳): 本研究では,R. solani接種がLactuca sativa L. 種子の発芽と初期発生に及ぼす効果について,低コストで画像ベースのモニタリングシステムを用いて検討した。
複数のカメラが配置され、感染群とコントロール群の両方で発芽過程の画像が継続的に撮影された。
本研究の目的は発芽動態と時間的成長を解析することにより病原体への影響を評価することである。
そこで,新しい画像解析パイプラインを開発した。
このアルゴリズムは、従来の画像解析が失敗する複雑な条件下であっても、形態的特徴と空間的特徴を統合して、個々の苗を同定し、定量化する。
各分析ステップは、現在の状態だけでなく、以前の時間点を越えてその発達も考慮します。
このアプローチは、特に重なり合う葉がオブジェクトの分離を著しく妨げている場合、個々の苗の堅牢な識別を可能にする。
本手法は, 密生・密生を特徴とする難易度シナリオにおいても, 苗数・活力評価において高い精度を示した。
結果,R. solani感染は発芽率と初期苗活力を大幅に低下させることが明らかとなった。
この研究は、低コストの撮像ハードウェアと高度な計算ツールを組み合わせることで、非破壊的でスケーラブルな表現型データを得る可能性についても検証した。
時間的統合により発芽種子の正確な定量化と開芽時期の正確な決定が可能となった。
この手法は実験の後期において特に有効であることが証明され、従来のセグメンテーション技術は重なりあるいは絡み合った苗によって失敗し、正確な計数が可能となった。
この方法は0.98の判定係数と1.12の根平均二乗誤差(RMSE)を達成し、その堅牢性と信頼性を実証した。
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