論文の概要: HiF-DTA: Hierarchical Feature Learning Network for Drug-Target Affinity Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.27281v1
- Date: Fri, 31 Oct 2025 08:47:15 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-03 17:52:16.041038
- Title: HiF-DTA: Hierarchical Feature Learning Network for Drug-Target Affinity Prediction
- Title(参考訳): HiF-DTA:ドラッグターゲット親和性予測のための階層的特徴学習ネットワーク
- Authors: Minghui Li, Yuanhang Wang, Peijin Guo, Wei Wan, Shengshan Hu, Shengqing Hu,
- Abstract要約: マルチスケールの薬品をモデル化し,マルチスケールのバイ線形アテンションモジュールを通じて融合した原子,サブ構造,分子表現を学習する階層型ネットワークであるHiF-DTAを提案する。
Davis、KIBA、Metzデータセットの実験では、HiF-DTAは最先端のベースラインよりも優れており、グローバルな局所抽出とマルチスケール融合の重要性が確認されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 26.44048308028745
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate prediction of Drug-Target Affinity (DTA) is crucial for reducing experimental costs and accelerating early screening in computational drug discovery. While sequence-based deep learning methods avoid reliance on costly 3D structures, they still overlook simultaneous modeling of global sequence semantic features and local topological structural features within drugs and proteins, and represent drugs as flat sequences without atomic-level, substructural-level, and molecular-level multi-scale features. We propose HiF-DTA, a hierarchical network that adopts a dual-pathway strategy to extract both global sequence semantic and local topological features from drug and protein sequences, and models drugs multi-scale to learn atomic, substructural, and molecular representations fused via a multi-scale bilinear attention module. Experiments on Davis, KIBA, and Metz datasets show HiF-DTA outperforms state-of-the-art baselines, with ablations confirming the importance of global-local extraction and multi-scale fusion.
- Abstract(参考訳): DTA(Darget Affinity)の正確な予測は、実験コストの削減と、計算薬物発見における早期スクリーニングの促進に不可欠である。
シークエンスベースのディープラーニング手法は、コストのかかる3D構造に依存しないが、ドラッグやタンパク質のグローバルな配列のセマンティックな特徴と局所的なトポロジカルな構造的特徴を同時にモデル化し、原子レベル、サブ構造レベル、分子レベルのマルチスケールな特徴を伴わないフラットな配列としてドラッグを表現している。
薬物およびタンパク質配列からグローバルな配列意味的特徴と局所的なトポロジ的特徴の両方を抽出するデュアルパス戦略を採用した階層型ネットワークHiF-DTAを提案する。
Davis、KIBA、Metzデータセットの実験では、HiF-DTAは最先端のベースラインよりも優れており、グローバルな局所抽出とマルチスケール融合の重要性が確認されている。
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