論文の概要: SynthStrategy: Extracting and Formalizing Latent Strategic Insights from LLMs in Organic Chemistry
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.01507v1
- Date: Mon, 01 Dec 2025 10:33:00 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-02 19:46:34.80321
- Title: SynthStrategy: Extracting and Formalizing Latent Strategic Insights from LLMs in Organic Chemistry
- Title(参考訳): 合成戦略:有機化学におけるLCMからの潜在戦略の抽出と定式化
- Authors: Daniel Armstrong, Zlatko Jončev, Andres M Bran, Philippe Schwaller,
- Abstract要約: 本稿では,大規模言語モデルを用いて合成知識をコードに抽出する手法を提案する。
本システムでは, 合成経路を解析し, 戦略原理を多種多様な戦略的, 戦術的ルールを表すPython関数に変換する。
この研究は、CASPにおける戦術的戦略的分割を橋渡しし、戦略的基準によるルートの仕様、探索、評価を可能にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.220916808049659
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Modern computer-assisted synthesis planning (CASP) systems show promises at generating chemically valid reaction steps but struggle to incorporate strategic considerations such as convergent assembly, protecting group minimization, and optimal ring-forming sequences. We introduce a methodology that leverages Large Language Models to distill synthetic knowledge into code. Our system analyzes synthesis routes and translates strategic principles into Python functions representing diverse strategic and tactical rules, such as strategic functional group interconversions and ring construction strategies. By formalizing this knowledge as verifiable code rather than simple heuristics, we create testable, interpretable representations of synthetic strategy. We release the complete codebase and the USPTO-ST dataset -- synthesis routes annotated with strategic tags. This framework unlocks a novel capability for CASP: natural language-based route retrieval, achieving 75\% Top-3 accuracy on our benchmark. We further validate our library through temporal analysis of historical trends and chemically intuitive route clustering that offers more granular partitioning than common previous methods. This work bridges the tactical-strategic divide in CASP, enabling specification, search, and evaluation of routes by strategic criteria rather than structure alone.
- Abstract(参考訳): 現代のコンピュータ支援合成計画システム(CASP)は、化学的に有効な反応ステップを生成することを約束するが、収束アセンブリ、グループ最小化の保護、最適なリング形成シーケンスといった戦略的考察を統合するのに苦労している。
本稿では,大規模言語モデルを用いて合成知識をコードに抽出する手法を提案する。
本システムでは, 戦略的機能群間変換やリング構築戦略など, 多様な戦略的, 戦術的ルールを表すPython関数に, 戦略的原理を翻訳する。
この知識を単純なヒューリスティックスではなく検証可能なコードとして形式化することにより、我々は合成戦略の検証可能な解釈可能な表現を作成する。
完全なコードベースとUSPTO-STデータセット -- 戦略的タグを付加した合成ルート -- をリリースします。
このフレームワークは、CASPの新たな機能である自然言語ベースのルート検索を解放し、ベンチマークで75%のTop-3精度を達成する。
さらに,従来の方法よりも粒度を細かく分割する手法として,歴史的傾向の時間的分析,化学的に直感的な経路クラスタリングなどを通じて,図書館の検証を行っている。
この作業は、CASPにおける戦術的戦略的な分割を橋渡しし、構造のみではなく、戦略的基準によるルートの仕様、探索、評価を可能にする。
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