論文の概要: Template-Free Retrosynthesis with Graph-Prior Augmented Transformers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.10770v2
- Date: Mon, 15 Dec 2025 12:53:39 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-16 15:10:29.245666
- Title: Template-Free Retrosynthesis with Graph-Prior Augmented Transformers
- Title(参考訳): Graph-Prior Augmented Transformerを用いたテンプレートフリー再合成
- Authors: Youjun Zhao,
- Abstract要約: 再合成反応予測は、与えられた生成物に対して可塑性反応分子を推測することを目的としている。
我々は手作りの反応テンプレートや追加の化学ルールエンジンを必要としないテンプレートフリーのトランスフォーマーベースのフレームワークを提案する。
本モデルでは,分子グラフ情報をアテンション機構に注入し,SMILES配列と構造的手がかりを併用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.538209532048867
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Retrosynthesis reaction prediction aims to infer plausible reactant molecules for a given product and is a important problem in computer-aided organic synthesis. Despite recent progress, many existing models still fall short of the accuracy and robustness required for practical deployment. In this paper, we present a template-free, Transformer-based framework that removes the need for handcrafted reaction templates or additional chemical rule engines. Our model injects molecular graph information into the attention mechanism to jointly exploit SMILES sequences and structural cues, and further applies a paired data augmentation strategy to enhance training diversity and scale. Extensive experiments on the USPTO-50K benchmark demonstrate that our approach achieves state-of-the-art performance among template-free methods and substantially outperforms a vanilla Transformer baseline.
- Abstract(参考訳): 再合成反応予測は、与えられた生成物に対して可塑性反応分子を推定することを目的としており、コンピュータ支援有機合成において重要な問題である。
最近の進歩にもかかわらず、既存のモデルの多くは、実際の配備に必要な正確さと堅牢さに欠けています。
本稿では,手作りの反応テンプレートや追加の化学ルールエンジンの必要性を解消する,テンプレートフリーのトランスフォーマーベースのフレームワークを提案する。
本モデルは,SMILES配列と構造的手がかりを共同で活用するために,注意機構に分子グラフ情報を注入し,さらに,トレーニングの多様性と規模を高めるために,ペア化されたデータ拡張戦略を適用した。
USPTO-50Kベンチマークの大規模実験により,テンプレートフリー手法の最先端性能を実証し,バニラトランスフォーマーのベースラインを大幅に上回る結果を得た。
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