論文の概要: Comparison of different segmentation algorithms on brain volume and fractal dimension in infant brain MRIs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.12222v1
- Date: Sat, 13 Dec 2025 07:23:32 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-16 17:54:56.17293
- Title: Comparison of different segmentation algorithms on brain volume and fractal dimension in infant brain MRIs
- Title(参考訳): 乳児脳MRIにおける脳体積とフラクタル次元の異なるセグメンテーションアルゴリズムの比較
- Authors: Nathalie Alexander, Arnaud Gucciardi, Umberto Michelucci,
- Abstract要約: SynthSegとSamSegの2つの手法は、Dice, Intersection over Union, 95th-centile Hausdorff distance, Normalized Mutual Informationを用いて専門家のアノテーションに対して評価された。
SynthSegは, 小児MRIにおいて最も信頼性の高い容積とFD値を示したが, 容積とFDの形態的差は小さかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.772560621487328
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of infant brain MRI is essential for quantifying developmental changes in structure and complexity. However, ongoing myelination and reduced tissue contrast make automated segmentation particularly challenging. This study systematically compared segmentation accuracy and its impact on volumetric and fractal dimension (FD) estimates in infant brain MRI using the Baby Open Brains (BOB) dataset (71 scans, 1-9 months). Two methods, SynthSeg and SamSeg, were evaluated against expert annotations using Dice, Intersection over Union, 95th-percentile Hausdorff distance, and Normalised Mutual Information. SynthSeg outperformed SamSeg across all quality metrics (mean Dice > 0.8 for major regions) and provided volumetric estimates closely matching the manual reference (mean +4% [-28% - 71%]). SamSeg systematically overestimated ventricular and whole-brain volumes (mean +76% [-12% - 190%]). Segmentation accuracy improved with age, consistent with increasing tissue contrast during myelination. Fractal dimension a(FD) nalyses revealed significant regional differences between SynthSeg and expert segmentations, and Bland-Altman limits of agreement indicated that segmentation-related FD variability exceeded most group differences reported in developmental cohorts. Volume and FD deviations were positively correlated across structures, indicating that segmentation bias directly affects FD estimation. Overall, SynthSeg provided the most reliable volumetric and FD results for paediatric MRI, yet small morphological differences in volume and FD should be interpreted with caution due to segmentation-related uncertainty.
- Abstract(参考訳): 乳児脳MRIの正確なセグメンテーションは、構造と複雑さの発達変化の定量化に不可欠である。
しかし、進行する髄化と組織コントラストの低下は、特に自動セグメンテーションを困難にしている。
本研究では,Bby Open Brains (BOB) データセット (71スキャン, 1-9ヶ月) を用いて, 乳児脳MRIにおける分画精度と体積次元およびフラクタル次元(FD)推定への影響を系統的に比較した。
SynthSegとSamSegの2つの手法は、Dice, Intersection over Union, 95th-centile Hausdorff distance, Normalized Mutual Informationを用いて専門家のアノテーションに対して評価された。
SynthSegはすべての品質指標(主要地域ではDice > 0.8)でSamSegを上回り、手動参照と密接に一致するボリューム推定(平均+4% [-28% - 71%])を提供した。
SamSegは、系統的に心室および全脳容積(平均+76% [-12% - 190%])を過大評価した。
セグメンテーションの精度は年齢とともに改善し,ミエリン化時の組織コントラストの増大と一致した。
フラクタル次元a(FD)解析では,SynthSegとエキスパートセグメンテーションの間に有意な地域差が認められた。
体積とFDの偏差は構造間で正の相関を示し, 偏差が直接FD推定に影響を及ぼすことを示した。
全体としては、SynthSegは小児MRIにおいて最も信頼性の高い容積とFDの成績を示したが、容積とFDの小さな形態的差異はセグメンテーションに関連する不確実性から慎重に解釈すべきである。
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