論文の概要: Feature Learning with Multi-Stage Vision Transformers on Inter-Modality HER2 Status Scoring and Tumor Classification on Whole Slides
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.22335v1
- Date: Fri, 26 Dec 2025 17:45:09 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-30 22:37:30.003078
- Title: Feature Learning with Multi-Stage Vision Transformers on Inter-Modality HER2 Status Scoring and Tumor Classification on Whole Slides
- Title(参考訳): モード間HER2における多段視覚変換器を用いた特徴学習と全スライド上の腫瘍分類
- Authors: Olaide N. Oyelade, Oliver Hoxey, Yulia Humrye,
- Abstract要約: スライド画像にHER2ステータスをスコア付けした視覚変換器システムを用いて,単一のエンドツーエンドパイプラインを提案する。
臨床的にインスピレーションを受けたHER2スコアリング機構がパイプラインに埋め込まれ、4方向のHER2スコアリングの画素レベルの自動アノテーションが可能である。
提案手法は,HER2陰性およびHER2陽性を正確に返却する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The popular use of histopathology images, such as hematoxylin and eosin (H&E), has proven to be useful in detecting tumors. However, moving such cancer cases forward for treatment requires accurate on the amount of the human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) protein expression. Predicting both the lower and higher levels of HER2 can be challenging. Moreover, jointly analyzing H&E and immunohistochemistry (IHC) stained images for HER2 scoring is difficult. Although several deep learning methods have been investigated to address the challenge of HER2 scoring, they suffer from providing a pixel-level localization of HER2 status. In this study, we propose a single end-to-end pipeline using a system of vision transformers with HER2 status scoring on whole slide images of WSIs. The method includes patch-wise processing of H&E WSIs for tumor localization. A novel mapping function is proposed to correspondingly identify correlated IHC WSIs regions with malignant regions on H&E. A clinically inspired HER2 scoring mechanism is embedded in the pipeline and allows for automatic pixel-level annotation of 4-way HER2 scoring (0, 1+, 2+, and 3+). Also, the proposed method accurately returns HER2-negative and HER2-positive. Privately curated datasets were collaboratively extracted from 13 different cases of WSIs of H&E and IHC. A thorough experiment is conducted on the proposed method. Results obtained showed a good classification accuracy during tumor localization. Also, a classification accuracy of 0.94 and a specificity of 0.933 were returned for the prediction of HER2 status, scoring in the 4-way methods. The applicability of the proposed pipeline was investigated using WSIs patches as comparable to human pathologists. Findings from the study showed the usability of jointly evaluated H&E and IHC images on end-to-end ViTs-based models for HER2 scoring
- Abstract(参考訳): ヘマトキシリンやエオシン(H&E)などの病理像の一般的な使用は腫瘍の検出に有用であることが証明されている。
しかし、そのようながん症例を治療のために前進させるには、ヒト上皮成長因子受容体2(HER2)タンパク質の発現量を正確にする必要がある。
低レベルのHER2と高レベルのHER2を予測することは困難である。
さらに,HER2スコアリングのためのH&Eと免疫組織化学(IHC)染色画像の同時解析も困難である。
HER2スコアリングの課題に対処するために、いくつかのディープラーニング手法が研究されているが、HER2ステータスのピクセルレベルのローカライズの提供に苦慮している。
本研究では,WSIのスライド画像全体に対してHER2状態の視覚変換器を用いた単一エンドツーエンドパイプラインを提案する。
本発明の方法は、腫瘍局在のためのH&E WSIのパッチワイド処理を含む。
H&E上の悪性領域と相関するIHC WSIs領域を同定するための新しいマッピング機能を提案する。
臨床的にインスピレーションを受けたHER2スコアリング機構がパイプラインに埋め込まれ、4ウェイHER2スコア(0, 1+, 2+, 3+)の自動ピクセルレベルのアノテーションが可能である。
また,提案手法はHER2陰性およびHER2陽性を正確に返却する。
プライベートキュレートされたデータセットは、H&EとIHCのWSIの13の異なるケースから共同で抽出された。
提案手法について詳細な実験を行った。
その結果,腫瘍局所化時の分類精度は良好であった。
また、HER2状態の予測には、0.94の分類精度と0.933の特異性が返され、4ウェイ法でスコアが得られた。
提案したパイプラインの適用性について,ヒト病理学者に匹敵するWSIsパッチを用いて検討した。
HER2スコアリングのためのエンド・ツー・エンドViTsモデルにおける共同評価H&EおよびIHC画像の有用性について検討した。
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