論文の概要: Mind the Gap: Continuous Magnification Sampling for Pathology Foundation Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.02198v1
- Date: Mon, 05 Jan 2026 15:19:59 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-06 16:25:23.237622
- Title: Mind the Gap: Continuous Magnification Sampling for Pathology Foundation Models
- Title(参考訳): Mind the Gap: 病理基盤モデルのための継続的拡大サンプリング
- Authors: Alexander Möllers, Julius Hense, Florian Schulz, Timo Milbich, Maximilian Alber, Lukas Ruff,
- Abstract要約: 広範に使用されている離散的な倍率の均一サンプリングにより,中間倍率の劣化が生じることを示す。
倍率スケールで表現品質を最適化するサンプリング分布を導出する。
実験により、連続サンプリングは中間倍率での離散サンプリングよりも大幅に改善されることが示された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 39.846652646235036
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In histopathology, pathologists examine both tissue architecture at low magnification and fine-grained morphology at high magnification. Yet, the performance of pathology foundation models across magnifications and the effect of magnification sampling during training remain poorly understood. We model magnification sampling as a multi-source domain adaptation problem and develop a simple theoretical framework that reveals systematic trade-offs between sampling strategies. We show that the widely used discrete uniform sampling of magnifications (0.25, 0.5, 1.0, 2.0 mpp) leads to degradation at intermediate magnifications. We introduce continuous magnification sampling, which removes gaps in magnification coverage while preserving performance at standard scales. Further, we derive sampling distributions that optimize representation quality across magnification scales. To evaluate these strategies, we introduce two new benchmarks (TCGA-MS, BRACS-MS) with appropriate metrics. Our experiments show that continuous sampling substantially improves over discrete sampling at intermediate magnifications, with gains of up to 4 percentage points in balanced classification accuracy, and that optimized distributions can further improve performance. Finally, we evaluate current histopathology foundation models, finding that magnification is a primary driver of performance variation across models. Our work paves the way towards future pathology foundation models that perform reliably across magnifications.
- Abstract(参考訳): 病理組織学では、組織構造を低倍率で、微細な形態を高倍率で調べる。
しかし, 病理基盤モデルの性能とトレーニング中の倍率サンプリングの効果は, いまだによく分かっていない。
マルチソース領域適応問題として拡大サンプリングをモデル化し、サンプリング戦略間の体系的なトレードオフを明らかにするための単純な理論的枠組みを開発する。
広く使用されている離散的な倍率サンプリング (0.25, 0.5, 1.0, 2.0 mpp) は中間倍率で劣化することを示した。
我々は,標準的なスケールで性能を保ちながら,倍率範囲のギャップを除去する連続倍率サンプリングを導入する。
さらに、拡大スケールで表現品質を最適化するサンプリング分布を導出する。
これらの戦略を評価するために、適切なメトリクスを持つ2つの新しいベンチマーク(TCGA-MS, BRACS-MS)を導入する。
実験により, 連続サンプリングは, 中間倍率での離散サンプリングよりも大幅に向上し, バランスの取れた分類精度で最大4ポイント向上し, 最適化された分布により性能が向上することを示した。
最後に,現在の病理組織学基盤モデルを評価し,モデル間の性能変動の主要因は倍率であることを確認した。
我々の研究は、拡大的に確実に機能する将来の病理基盤モデルへの道を開いた。
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